RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	AVT1	P47082	602 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	NSI1	Q12457	570 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	POL32	P47110	350 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PEX18	YHR160C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	MCM2	P29469	868 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	LRG1	P35688	1017 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	PEX7	P39108	375 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	TPP1	Q03796	238 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	TRE1	Q08919	783 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.7	□□□□□ -1.5	not detected
PEX18	YHR160C	YGR122W	P53272	402 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	SSY1	Q03770	852 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	LAP2	Q10740	671 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	PRO1	P32264	428 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	HSP78	P33416	811 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	ADD66	P36040	267 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	ATG14	P38270	344 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	SPR28	Q04921	423 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	RAD2	P07276	1031 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	CYC8	P14922	966 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	ADP1	P25371	1049 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	SEG2	P34250	1132 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	MGE1	P38523	228 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	PTC7	P38797	343 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	MRPS18	P42847	217 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	EST2	Q06163	884 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	DFG16	Q99234	619 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	AFG2	P32794	780 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	HSE1	P38753	452 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	FYV10	P40492	516 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	GTS1	P40956	396 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	YJL045W	P47052	634 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	HDA2	Q06629	674 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	MCD1	Q12158	566 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	HEM3	P28789	327 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	YJR107W	P47145	328 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	RKM2	Q03942	479 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PEX18	YHR160C	SAM35	P14693	329 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	RNQ1	P25367	405 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	IRC24	P40580	263 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	ROD1	Q02805	837 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	YHL012W	P38709	493 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	SEC8	P32855	1065 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	VPS53	P47061	822 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	PTC5	Q12511	572 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	GCR1	P07261	785 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	KIP1	P28742	1111 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	ELM1	P32801	640 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	ALG3	P38179	458 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	GPB2	P39717	880 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	ECL1	P48235	211 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	AOS1	Q06624	347 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	YSC84	P32793	468 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	ORC3	P54790	616 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	MRL1	Q06815	381 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	PEP7	P32609	515 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	HXT13	P39924	564 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	GNP1	P48813	663 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	HXT17	P53631	564 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	SIW14	P53965	281 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	HXT15	P54854	567 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
PEX18	YHR160C	TAF13	P11747	167 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	MKK2	P32491	506 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	AIM26	P32858	118 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	MDL2	P33311	773 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	YDL177C	Q12257	170 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.56	□□□□□ -1.52	not detected
PEX18	YHR160C	CDA2	Q06703	312 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	RSC58	Q07979	502 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	SPO21	Q12411	609 aa		5.55	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	ASF1	P32447	279 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	UBP5	P39944	805 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	NIT1	P40447	199 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	YFL054C	P43549	646 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
PEX18	YHR160C	COQ4	O13525	335 aa		5.52	□□□□□ -1.53

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