RNA–Protein interactions for RNA: YGL039W

YGL039W, Transcript of Oxidoreductase shown to reduce carbonyl compounds to chiral alcohols, yeast

Gene YGL039W, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL039W	YGL039W	MEC3	Q02574	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	CDA2	Q06703	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	MSH3	P25336	1018 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	SHU2	P38957	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	TAF1	P46677	1066 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	RCM1	P53972	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	SVF1	Q05515	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	MCD1	Q12158	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	YKL077W	P36081	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	GPT2	P36148	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	RDH54	P38086	958 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	NEM1	P38757	446 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	PEX28	P38848	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	GIP4	P39732	760 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	RSM26	P47141	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	SQT1	P35184	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	MRPS18	P42847	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	SLS1	P42900	643 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	PEX13	P80667	386 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	RMD1	Q03441	430 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	PEP7	P32609	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YGL039W	YGL039W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	GNP1	P48813	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	ADP1	P25371	1049 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	THI80	P35202	319 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	XKS1	P42826	600 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	YGR045C	P53229	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
YGL039W	YGL039W	GCR1	P07261	785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	TAF13	P11747	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	MAD1	P40957	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	HDA2	Q06629	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	DUT1	P33317	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	HXT13	P39924	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	HXT17	P53631	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	ORC3	P54790	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	HXT15	P54854	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	GIS1	Q03833	894 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	PET112	P33893	541 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	YAR028W	P39548	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	ENT3	P47160	408 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	SIW14	P53965	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	RKM2	Q03942	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	EST2	Q06163	884 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YGL039W	YGL039W	CLN2	P20438	545 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	AFG2	P32794	780 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	MNR2	P35724	969 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	ADD66	P36040	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	FLR1	P38124	548 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	ROD1	Q02805	837 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	SSY1	Q03770	852 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	MRL1	Q06815	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	TRE1	Q08919	783 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	CDC34	P14682	295 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	NNF1	P47149	201 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	ALT1	P52893	592 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	CWC24	P53769	259 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	NFS1	P25374	497 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	NNK1	P36003	928 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	YNR063W	P53749	607 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	EAR1	Q03212	550 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	VPS16	Q03308	798 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	PRO1	P32264	428 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	MKK2	P32491	506 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	EEB1	Q02891	456 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	PIN2	Q12057	282 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YGL039W	YGL039W	LAP2	Q10740	671 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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