RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 DCTPP1Q9H773 170 aa24.92■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 APBB1O00213 710 aa24.92■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRB1P82279 1406 aa24.91■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 EID1Q9Y6B2 187 aa24.91■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP10DQ9P241 1426 aa24.91■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC4A2P04920 1241 aa24.91■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARXQ96QS3 562 aa24.91■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 MEIS3Q99687 375 aa24.91■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX21Q969T3 373 aa24.89■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.89■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA0232Q92628 1395 aa24.89■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP85Q6P2H3 762 aa24.88■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.88■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 G2E3Q7L622 706 aa24.88■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.88■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.88■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.87■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 EYA1Q99502 592 aa24.87■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 RTL1A6NKG5 1358 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 F6X3S4 739 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDC45O75419 566 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDIT3P35638 169 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMPHP49418 695 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF10O15013 1369 aa24.85■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.85■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.84■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 FLT4P35916 1363 aa24.84■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.84■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPRCP08575 1304 aa24.84■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 SBNO1A3KN83 1393 aa24.84■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC22Q5TAA0 569 aa24.83■■□□□ 1.57
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 TBX22Q9Y458 520 aa24.82■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 DIP2AQ14689 1571 aa24.81■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRAK2O60296 914 aa24.81■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 NLRP6P59044 892 aa24.81■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDRP35968 1356 aa24.8■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.8■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 NECTIN2Q92692 538 aa24.8■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIK3C2AO00443 1686 aa24.79■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLIT1O75093 1534 aa24.77■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.77■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 SDSP20132 328 aa24.77■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNA6P17658 529 aa24.76■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.75■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXC9P31274 260 aa24.73■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.72■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.72■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP26Q9BXU7 913 aa24.72■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.71■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.71■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.71■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABTB2Q8N961 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.71■■□□□ 1.55
AFG3L1P-217ENST00000557444 FSD2A1L4K1 749 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 C14orf37Q86TY3 774 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL17REQ8NFR9 667 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK31Q9BXU1 1019 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 PANK2Q9BZ23 570 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 FLIIQ13045 1269 aa24.69■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 AK9Q5TCS8 1911 aa24.68■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 HMMRO75330 724 aa24.67■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 SSFA2P28290 1259 aa24.67■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 NWD1Q149M9 1564 aa24.67■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 GNAI2P04899 355 aa24.66■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.66■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.65■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 RABEP1Q15276 862 aa24.65■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE1AP54750 535 aa24.64■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.64■■□□□ 1.54
AFG3L1P-217ENST00000557444 GBP4Q96PP9 640 aa24.64■■□□□ 1.53
AFG3L1P-217ENST00000557444 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC37A3O60309 1634 aa24.63■■□□□ 1.53
AFG3L1P-217ENST00000557444 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP3K5Q99683 1374 aa24.63■■□□□ 1.53
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