RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 NEFMP07197 916 aa6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 BAG6P46379 1132 aa6.65□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.65□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 NBPF4Q96M43 638 aa6.65□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 POLKQ9UBT6 870 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SSH2Q76I76 1423 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ITSN1Q15811 1721 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ERBB3P21860 1342 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.64□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 RGS12O14924 1447 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 MIER1Q8N108 512 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 NUDCQ9Y266 331 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 KCNQ4P56696 695 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 EYA1Q99502 592 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SHPRHQ149N8 1683 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 FLT4P35916 1363 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ATRNO75882 1429 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 CRB1P82279 1406 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SLIT2O94813 1529 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 KCNQ2O43526 872 aa6.62□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 CPDO75976 1380 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SEMA3EO15041 775 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ANP32CO43423 234 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SPDYE6P0CI01 402 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 USP31Q70CQ4 1352 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 A6NJR5 290 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 SPG7Q9UQ90 795 aa6.61□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.6□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 PPP2R1AP30153 589 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 STK25O00506 426 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLVS1-205ENST00000519846 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.59□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 PRKAR2BP31323 418 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 AK7Q96M32 723 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 PIK3C2AO00443 1686 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 NBPF14Q5TI25 921 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 INSRP06213 1382 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 CABP4P57796 275 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 MRS2Q9HD23 443 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 IGSF3O75054 1194 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-205ENST00000519846 TEFQ10587 303 aa6.57□□□□□ -1.36
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