RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.46□□□□□ -0.58
CLVS1-205ENST00000519846 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.38□□□□□ -0.59
CLVS1-205ENST00000519846 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CLVS1-205ENST00000519846 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CLVS1-205ENST00000519846 ABCC9O60706 1549 aa10.11□□□□□ -0.79
CLVS1-205ENST00000519846 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.1□□□□□ -0.79
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.92□□□□□ -0.82
CLVS1-205ENST00000519846 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CLVS1-205ENST00000519846 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-205ENST00000519846 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-205ENST00000519846 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.46□□□□□ -0.9
CLVS1-205ENST00000519846 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CLVS1-205ENST00000519846 NACADO15069 1562 aa9.43□□□□□ -0.9
CLVS1-205ENST00000519846 SCRIBQ14160 1630 aa9.35□□□□□ -0.91
CLVS1-205ENST00000519846 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.29□□□□□ -0.92
CLVS1-205ENST00000519846 SLC24A1O60721 1099 aa9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-205ENST00000519846 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-205ENST00000519846 KCNA4P22459 653 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-205ENST00000519846 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.23□□□□□ -0.93
CLVS1-205ENST00000519846 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.22□□□□□ -0.93
CLVS1-205ENST00000519846 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.22□□□□□ -0.93
CLVS1-205ENST00000519846 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.14□□□□□ -0.95
CLVS1-205ENST00000519846 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.13□□□□□ -0.95
CLVS1-205ENST00000519846 CECR2Q9BXF3 1484 aa9□□□□□ -0.97
CLVS1-205ENST00000519846 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CLVS1-205ENST00000519846 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CLVS1-205ENST00000519846 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CLVS1-205ENST00000519846 ADRA2BP18089 450 aa8.97□□□□□ -0.97
CLVS1-205ENST00000519846 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.95□□□□□ -0.98
CLVS1-205ENST00000519846 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.84□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.83□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.81□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 SMARCA4P51532 1647 aa8.8□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CLVS1-205ENST00000519846 SMARCA2P51531 1590 aa8.76□□□□□ -1.01
CLVS1-205ENST00000519846 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CLVS1-205ENST00000519846 NCAPD3P42695 1498 aa8.74□□□□□ -1.01
CLVS1-205ENST00000519846 ERCC6Q03468 1493 aa8.74□□□□□ -1.01
CLVS1-205ENST00000519846 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-205ENST00000519846 WIZO95785 1651 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-205ENST00000519846 ZBTB22O15209 634 aa8.72□□□□□ -1.01
CLVS1-205ENST00000519846 NESP48681 1621 aa8.69□□□□□ -1.02
CLVS1-205ENST00000519846 HMGXB3Q12766 1538 aa8.63□□□□□ -1.03
CLVS1-205ENST00000519846 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.6□□□□□ -1.03
CLVS1-205ENST00000519846 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.58□□□□□ -1.04
CLVS1-205ENST00000519846 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-205ENST00000519846 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.56□□□□□ -1.04
CLVS1-205ENST00000519846 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.51□□□□□ -1.05
CLVS1-205ENST00000519846 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.5□□□□□ -1.05
CLVS1-205ENST00000519846 FBLN2P98095 1184 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-205ENST00000519846 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-205ENST00000519846 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-205ENST00000519846 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-205ENST00000519846 CFTRP13569 1480 aa8.46□□□□□ -1.05
CLVS1-205ENST00000519846 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CLVS1-205ENST00000519846 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.44□□□□□ -1.06
CLVS1-205ENST00000519846 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.43□□□□□ -1.06
CLVS1-205ENST00000519846 CUX2O14529 1486 aa8.39□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 TRIM41Q8WV44 630 aa8.36□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 FOXD1Q16676 465 aa8.36□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 SOGA1O94964 1423 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.34□□□□□ -1.07
CLVS1-205ENST00000519846 TOPBP1Q92547 1522 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 ABCC8Q09428 1581 aa8.33□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 OSCARQ8IYS5 282 aa8.3□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.3□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 WDR62O43379 1518 aa8.29□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.28□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CLVS1-205ENST00000519846 IFT140Q96RY7 1462 aa8.27□□□□□ -1.09
CLVS1-205ENST00000519846 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.27□□□□□ -1.09
CLVS1-205ENST00000519846 CUX1P39880 1505 aa8.26□□□□□ -1.09
CLVS1-205ENST00000519846 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.22□□□□□ -1.09
CLVS1-205ENST00000519846 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.21□□□□□ -1.09
CLVS1-205ENST00000519846 PRDM2Q13029 1718 aa8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.2□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 SYNJ1O43426 1573 aa8.19□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.18□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 GRIN2BQ13224 1484 aa8.16□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 KIF27Q86VH2 1401 aa8.15□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CLVS1-205ENST00000519846 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 P3H3Q8IVL6 736 aa8.13□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 TOP2BQ02880 1626 aa8.13□□□□□ -1.11
CLVS1-205ENST00000519846 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
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