RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP85Q6P2H3 762 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 MCM10Q7L590 875 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 MSH6P52701 1360 aa26.79■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 RTL1A6NKG5 1358 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPRCP08575 1304 aa26.76■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.76■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 CRB1P82279 1406 aa26.75■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 RABEP1Q15276 862 aa26.75■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.75■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 AK9Q5TCS8 1911 aa26.75■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 PTMSP20962 102 aa26.75■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 USP26Q9BXU7 913 aa26.75■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 ACEP12821 1306 aa26.74■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 SSFA2P28290 1259 aa26.74■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.74■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.74■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 MEIS3Q99687 375 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 USP6P35125 1406 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 USP31Q70CQ4 1352 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 SDSP20132 328 aa26.71■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 TNRQ92752 1358 aa26.71■■□□□ 1.87
TMEM200B-201ENST00000420504 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.69■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 SSH2Q76I76 1423 aa26.68■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC4A2P04920 1241 aa26.67■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 CLCN1P35523 988 aa26.67■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGEF10O15013 1369 aa26.67■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 NUTM2FA1L443 756 aa26.65■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 APBB1O00213 710 aa26.65■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.65■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.65■■□□□ 1.86
TMEM200B-201ENST00000420504 FOXO3O43524 673 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 G2E3Q7L622 706 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 CASC1Q6TDU7 716 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 KDRP35968 1356 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 HMMRO75330 724 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 SOX12O15370 315 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 NUCB2P80303 420 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 F6X3S4 739 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 REC8O95072 547 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 LTKP29376 864 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPRUQ92729 1446 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM200B-201ENST00000420504 SBNO1A3KN83 1393 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 FLT4P35916 1363 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 PDE1AP54750 535 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 ERBB4Q15303 1308 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 ERC2O15083 957 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 ST18O60284 1047 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 PKP1Q13835 747 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 LRRC37A3O60309 1634 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 ESPNB1AK53 854 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 GNAI2P04899 355 aa26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 MCTP1Q6DN14 999 aa26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 EYA1Q99502 592 aa26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.53■■□□□ 1.84
TMEM200B-201ENST00000420504 CACNA1FO60840 1977 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 546.2 ms