RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 DCCP43146 1447 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 MST1RQ04912 1400 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF428Q96B54 188 aa23.62■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 PIP4K2BP78356 416 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 MSH6P52701 1360 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 SLIT3O75094 1523 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 VAMP4O75379 141 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 IP6K1Q92551 441 aa23.61■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 ATF3P18847 181 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 AAMPQ13685 434 aa23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 MCM10Q7L590 875 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 TSPYL6Q8N831 410 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 KIF16BQ96L93 1317 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM27P14373 513 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 C8orf34Q49A92 452 aa23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.58■■□□□ 1.37
SPNS1-204ENST00000352260 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 SKAP1Q86WV1 359 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.57■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 USP19O94966 1318 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 CRB1P82279 1406 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 SLAIN2Q9P270 581 aa23.56■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 CHL1O00533 1208 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 IGHDP01880 384 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 GCP02774 474 aa23.55■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.53■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 ALS2Q96Q42 1657 aa23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SPNS1-204ENST00000352260 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHG5O94827 1062 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 NBPF4Q96M43 638 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC37A3O60309 1634 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA0232Q92628 1395 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K5Q99683 1374 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A3P48751 1232 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 KRT24Q2M2I5 525 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-204ENST00000352260 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 HSPA1LP34931 641 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 BECN1Q14457 450 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 NCAPD2Q15021 1401 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 PXDNQ92626 1479 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 BRINP3Q76B58 766 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 IL17REQ8NFR9 667 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC4O15439 1325 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-204ENST00000352260 RGS3P49796 1198 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 RGPD5Q99666 1765 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SPNS1-204ENST00000352260 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.4 ms