RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 VAMP4O75379 141 aa16.08■□□□□ 0.17
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SNX1-201ENST00000261889 RBSNQ9H1K0 784 aa16.08■□□□□ 0.17
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SNX1-201ENST00000261889 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.96■□□□□ 0.15
SNX1-201ENST00000261889 USP32Q8NFA0 1604 aa15.96■□□□□ 0.15
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SNX1-201ENST00000261889 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX1-201ENST00000261889 EID1Q9Y6B2 187 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-201ENST00000261889 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.93■□□□□ 0.14
SNX1-201ENST00000261889 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SNX1-201ENST00000261889 CPA1P15085 419 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-201ENST00000261889 MSH6P52701 1360 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-201ENST00000261889 GNAI1P63096 354 aa15.92■□□□□ 0.14
SNX1-201ENST00000261889 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.92■□□□□ 0.14
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