RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 CAMK4Q16566 473 aa24.03■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 AIDAQ96BJ3 306 aa24.02■■□□□ 1.44
ZBED3-201ENST00000255198 IQCEQ6IPM2 695 aa24.01■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.01■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 NUP62CLQ9H1M0 184 aa24.01■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 UBA5Q9GZZ9 404 aa24■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 ERICH4A6NGS2 130 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 UQCRHP07919 91 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.99■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 ANAPC15P60006 121 aa23.98■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.98■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.98■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 CFAP45Q9UL16 551 aa23.98■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 POTEJP0CG39 1038 aa23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 CFAP100Q494V2 611 aa23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 AFAP1Q8N556 730 aa23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.97■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 DNA2P51530 1060 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 METTL24Q5JXM2 366 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 LIG1P18858 919 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 WASF1Q92558 559 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.96■■□□□ 1.43
ZBED3-201ENST00000255198 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.95■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.95■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 WDR78Q5VTH9 848 aa23.95■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.95■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 SMTNL1A8MU46 457 aa23.95■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 TNIP1Q15025 636 aa23.95■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.94■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.94■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 GOPCQ9HD26 462 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 TMX1Q9H3N1 280 aa23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 PDE3AQ14432 1141 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 STAC3Q96MF2 364 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 TNNT1P13805 278 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 FERMT3Q86UX7 667 aa23.92■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 PSMD1Q99460 953 aa23.91■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 SPA17Q15506 151 aa23.9■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC96Q2M329 555 aa23.9■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.9■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.89■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 IL27Q8NEV9 243 aa23.89■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.89■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 GUCY1B3Q02153 619 aa23.89■■□□□ 1.42
ZBED3-201ENST00000255198 KRT32Q14532 448 aa23.89■■□□□ 1.41
ZBED3-201ENST00000255198 CETN2P41208 172 aa23.89■■□□□ 1.41
ZBED3-201ENST00000255198 AKNAQ7Z591 1439 aa23.88■■□□□ 1.41
ZBED3-201ENST00000255198 INCENPQ9NQS7 918 aa23.88■■□□□ 1.41
ZBED3-201ENST00000255198 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms