RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pogk	Q80TC5	607 aa		28.11	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Stk31	Q99MW1	1018 aa		28.11	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Smarca5	Q91ZW3	1051 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tm6sf1	P58749	370 aa		28.09	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Erich6b	Q9D4S6	220 aa		28.09	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Kif24	Q6NWW5	1356 aa		28.08	■■■□□ 2.09
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Impact	O55091	318 aa		28.07	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ptms	Q9D0J8	101 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Aifm3	Q3TY86	605 aa		28.07	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Elp1	Q7TT37	1333 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Prkar2b	P31324	416 aa		28.04	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142		Q9D2X8	372 aa		28.04	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cyp46a1	Q9WVK8	500 aa		28.04	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cyp27a1	Q9DBG1	533 aa		28.03	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Idi2	Q8BFZ6	227 aa		28.03	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Igha	A0A0A6YXW6	389 aa		28.02	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Dhx16	G3X8X0	1044 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Txndc2	Q6P902	515 aa		28.02	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rsph4a	Q8BYM7	716 aa		28.02	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Spef2	Q8C9J3	1734 aa		28.01	■■■□□ 2.08
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pibf1	E9Q6K3	756 aa		28.01	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mprip	P97434	1024 aa		28.01	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Erc2	Q6PH08	957 aa		28	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Chl1	P70232	1209 aa		27.99	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	4930407I10Rik	D3Z5T8	1512 aa		27.99	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tpm2	P58774	284 aa		27.99	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Hoxb7	P09024	217 aa		27.98	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	4931400O07Rik	Q9D4M5	137 aa		27.98	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Clcn1	Q64347	994 aa		27.98	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Atg4a-ps	A0A0G2JFS9	396 aa		27.97	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Atg4a	Q8C9S8	396 aa		27.97	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Scaper	F8VQ70	1398 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Vgf	Q0VGU4	617 aa		27.96	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Eif4a2	P10630	407 aa		27.95	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mrps27	Q8BK72	415 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Fez1	Q8K0X8	392 aa		27.95	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Chd2	E9PZM4	1827 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ush1c	Q9ES64	910 aa		27.94	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Dip2b	Q3UH60	1574 aa		27.93	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Alpk3	Q924C5	1678 aa		27.93	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Cc2d1a	Q8K1A6	943 aa		27.92	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gdpd2	Q9ESM6	539 aa		27.92	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zkscan16	A2ALW2	728 aa		27.91	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zdhhc9	P59268	364 aa		27.91	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Psme1	P97371	249 aa		27.91	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Bcar3	Q9QZK2	820 aa		27.91	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ggnbp2	Q5SV77	696 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Catip	B9EKE5	520 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zkscan2	G3X952	960 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tmpo	Q61033	693 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pdcl2	Q78Y63	240 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nexn	Q7TPW1	607 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Sv2b	Q8BG39	683 aa		27.9	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gm9992	B2RWK3	458 aa		27.89	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Unc93a	Q710D3	458 aa		27.89	■■■□□ 2.06
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ppl	Q9R269	1755 aa		27.89	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nwd1	A6H603	1563 aa		27.88	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Kif1a	P33173	1695 aa		27.88	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mcc	E9PWI3	1003 aa		27.88	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Zc3h13	E9Q784	1729 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Syce3	B5KM66	88 aa		27.87	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Becn1	O88597	448 aa		27.87	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rtf1	A2AQ19	715 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Glipr1l2	Q9CQ35	332 aa		27.86	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ptpru	B1AUH1	1446 aa		27.86	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Kif20b	Q80WE4	1774 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Phf23	Q8BSN5	401 aa		27.86	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Hsp90b1	P08113	802 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gripap1	Q8VD04	806 aa		27.85	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Filip1l	Q6P6L0	1131 aa		27.85	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Calca	P70160	136 aa		27.84	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Nphp1	Q9QY53	687 aa		27.84	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gnai2	P08752	355 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Kif4	P33174	1231 aa		27.83	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Phactr2	B1AVP0	632 aa		27.83	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Hmox1	P14901	289 aa		27.83	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Atp6v1d	P57746	247 aa		27.83	■■■□□ 2.05
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Srgap3	Q812A2	1099 aa		27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Anln	Q8K298	1121 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ap3b2	Q9JME5	1082 aa		27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Vwa3b	J9JI28	736 aa		27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Pdia4	P08003	638 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Chmp4c	Q9D7F7	232 aa		27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gadd45b	P22339	160 aa		27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Tex2	Q6ZPJ0	1128 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	St18	Q80TY4	1045 aa		27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rest	Q8VIG1	1082 aa		27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rbm10	Q99KG3	930 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ptpdc1	Q6NZK8	747 aa		27.81	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Llph	Q9D945	130 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gm45015	A0A140LII9	184 aa		27.8	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gm18336	A0A140LIU8	765 aa		27.8	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Mdc1	Q5PSV9	1707 aa		27.8	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Prim1	P20664	417 aa		27.79	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rnf214	Q8BFU3	668 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Prune1	Q8BIW1	454 aa		27.79	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Ppp1r42	Q8R1Z4	357 aa		27.79	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rcan3	Q9JKK0	239 aa		27.78	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Rnf123	Q5XPI3	1314 aa		27.78	■■■□□ 2.04
Nisch-222	ENSMUST00000172142	Gemin5	Q8BX17	1502 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04

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