RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	BOI2	P39969	1040 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	YNL193W	P53870	558 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	RMD1	Q03441	430 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	YDL144C	Q07589	356 aa		5.44	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	ERG12	P07277	443 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	RGT1	P32862	1170 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	YML037C	Q03703	340 aa		5.43	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	IRE1	P32361	1115 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		5.42	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	MPH3	P0CE00	602 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	GPB2	P39717	880 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	SKP2	P42843	763 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	YPP1	P46951	817 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	PIF1	P07271	859 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	BCK2	P33306	851 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	GRX7	P38068	203 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	PRE3	P38624	215 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	YNR014W	P53719	212 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	YAF9	P53930	226 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	CSI1	Q04368	295 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YNL057W	YNL057W	ECM29	P38737	1868 aa		5.4	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RAM2	P29703	316 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	UTR4	P32626	227 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	CYB2	P00175	591 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	PRE8	P23639	250 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	NPL4	P33755	580 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	JHD1	P40034	492 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	ATH1	P48016	1211 aa		5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	FAB1	P34756	2278 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	UBR2	Q07963	1872 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	NUM1	Q00402	2748 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	YKR018C	P36114	725 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	EDS1	P38073	919 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SLD5	Q03406	294 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	YPL260W	Q08977	551 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	DAP1	Q12091	152 aa		5.37	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SRM1	P21827	482 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	YUR1	P26725	428 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	GUT1	P32190	709 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SCS3	P53012	380 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	VID30	P53076	958 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	PML39	Q03760	334 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RAD18	P10862	487 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.35	□□□□□ -1.55	not detected
YNL057W	YNL057W	SHP1	P34223	423 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	YNL115C	P53925	644 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	VPS72	Q03388	795 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RTP1	Q12751	981 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	POX1	P13711	748 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	GPT2	P36148	743 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	RDH54	P38086	958 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	DSF2	P38213	736 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	VPS53	P47061	822 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	SOL4	P53315	255 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YNL057W	YNL057W	COQ8	P27697	501 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	CHS3	P29465	1165 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	POL32	P47110	350 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SGM1	P47166	707 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.33	□□□□□ -1.56	not detected
YNL057W	YNL057W	YDR344C	Q05510	147 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	SKG3	Q06315	1026 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	CSC1	Q06538	782 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YNL057W	YNL057W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.3 ms