RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	YMR074C	Q04773	145 aa		2.86	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.85	□□□□□ -1.95	not detected
STB4	YMR019W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.85	□□□□□ -1.95	not detected
STB4	YMR019W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	OCA5	P38738	679 aa		2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	YJR124C	P47159	448 aa		2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	DPH6	Q12429	685 aa		2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	MSH3	P25336	1018 aa		2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	AVO1	Q08236	1176 aa		2.85	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	YIR007W	P40566	764 aa		2.84	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	LSB6	P42951	607 aa		2.84	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	TPO2	P53283	614 aa		2.84	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	SRC1	Q03707	834 aa		2.84	□□□□□ -1.95
STB4	YMR019W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	ALG14	P38242	237 aa		2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GIP2	P40036	548 aa		2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GCV1	P48015	400 aa		2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YGL140C	P53120	1219 aa		2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	SIW14	P53965	281 aa		2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	EST2	Q06163	884 aa		2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	SPO75	Q07798	868 aa		2.84	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	COB	P00163	385 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	MSC7	P38694	644 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	OSH2	Q12451	1283 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	NHA1	Q99271	985 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GCR1	P07261	785 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	ADD66	P36040	267 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YGR035C	P53222	116 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YNR065C	P53751	1116 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	DSE4	P53753	1117 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	MEC3	Q02574	474 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	RKM2	Q03942	479 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	OPI10	Q08202	246 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YIG1	Q08956	461 aa		2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	LYP1	P32487	611 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	UGA4	P32837	571 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	MRP8	P35719	219 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PIC2	P40035	300 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	BAS1	P22035	811 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PPG1	P32838	368 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	VPS53	P47061	822 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	TOS4	Q06266	489 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PAN5	P38787	379 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	HNT2	P49775	206 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	TYW3	P53177	273 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YGR053C	P53234	283 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	NSE3	Q05541	303 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	ELG1	Q12050	791 aa		2.82	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	DUR3	P33413	735 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.81	□□□□□ -1.96	not detected
STB4	YMR019W	BRN1	P38170	754 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	EXO5	P38289	585 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	TIM54	P47045	478 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GIS4	Q04233	774 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	HDA2	Q06629	674 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	RKM4	Q12504	494 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	CCP1	P00431	361 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PRI2	P20457	528 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	AGP1	P25376	633 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	TFA2	P36145	328 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YAR028W	P39548	234 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	TED1	P40533	473 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	JJJ3	P47138	172 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YNR014W	P53719	212 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YOR223W	Q12015	292 aa		2.81	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	AI1	P03875	834 aa		2.8	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	HVG1	P0CE11	249 aa		2.8	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	CNN1	P43618	361 aa		2.8	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	SHE9	Q04172	456 aa		2.8	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	GAL11	P19659	1081 aa		2.8	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	YKL107W	P34251	309 aa		2.8	□□□□□ -1.96
STB4	YMR019W	MCM7	P38132	845 aa		2.8	□□□□□ -1.96

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