RNA–Protein interactions for RNA: YML113W

DAT1, Transcript of DNA binding protein that recognizes oligo(dA).oligo(dT) tracts, yeast

Gene DAT1, Length 747 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DAT1	YML113W	PCT1	P13259	424 aa		12	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	PKC1	P24583	1151 aa		12	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	ACE2	P21192	770 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	SOL4	P53315	255 aa		11.99	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	IMP2'	P32351	346 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	MYO3	P36006	1272 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	OPY1	P38271	328 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	GPB2	P39717	880 aa		11.98	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	UBP9	P39967	754 aa		11.97	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	RAD18	P10862	487 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	RIT1	P23796	513 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	ANP1	P32629	500 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	VPS62	P53285	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	ICL2	Q12031	575 aa		11.96	□□□□□ -0.49
DAT1	YML113W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.95	□□□□□ -0.5	not detected
DAT1	YML113W	SIS2	P36024	562 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	MXR1	P40029	184 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	SPO22	P40511	975 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	FOL1	P53848	824 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	ARP5	P53946	755 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	HDA1	P53973	706 aa		11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.94	□□□□□ -0.5	not detected
DAT1	YML113W	UTR4	P32626	227 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	YAF9	P53930	226 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	DUS4	Q06063	367 aa		11.94	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.94	□□□□□ -0.5	not detected
DAT1	YML113W	PEP3	P27801	918 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	11.93	□□□□□ -0.5	not detected
DAT1	YML113W	PES4	P39684	611 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	VPS30	Q02948	557 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	YKR018C	P36114	725 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	VID28	P40547	921 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	PRY3	P47033	881 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	MET7	Q08645	548 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	NUC1	P08466	329 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	RER2	P35196	286 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	LDH1	P38139	375 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	VPS20	Q04272	221 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	YOR131C	Q12486	218 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	RGT1	P32862	1170 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	TGL1	P34163	548 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	VPS45	P38932	577 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	YGR125W	P53273	1036 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	SUT2	Q12286	268 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DAT1	YML113W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	SUE1	Q06524	206 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	CSC1	Q06538	782 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	IME2	P32581	645 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	MAL31	P38156	614 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	AFG3	P39925	761 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	AIM21	P40563	679 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	NPA3	P47122	385 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	YGL081W	P53156	320 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	MAK31	P23059	88 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	SHP1	P34223	423 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	CSM2	P40465	213 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	ENT3	P47160	408 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	YKE2	P52553	114 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	SPH1	Q06160	661 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	TFC6	Q06339	672 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	BCS1	P32839	456 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	DJP1	P40564	432 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	YJR107W	P47145	328 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	EST2	Q06163	884 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	UIP5	P36137	443 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	VPS29	P38759	282 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	CTF18	P49956	741 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	SLD5	Q03406	294 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DAT1	YML113W	BIK1	P11709	440 aa		11.84	□□□□□ -0.51

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