RNA–Protein interactions for RNA: YLL042C

ATG10, Transcript of Conserved E2-like conjugating enzyme, yeast

Gene ATG10, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG10	YLL042C	SLP1	Q12232	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	PAN5	P38787	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	PEX28	P38848	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	LEM3	P42838	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	GNP1	P48813	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	MSH3	P25336	1018 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	DUT1	P33317	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	RSM26	P47141	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	VPS16	Q03308	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	YIG1	Q08956	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	PIN2	Q12057	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	PET112	P33893	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	SQT1	P35184	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	MNR2	P35724	969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	RDH54	P38086	958 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	NEM1	P38757	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	YFL066C	P43538	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	PEX13	P80667	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	NHA1	Q99271	985 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG10	YLL042C	AI1	P03875	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	GCR1	P07261	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	SHU2	P38957	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	XKS1	P42826	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	THI72	Q08579	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	REC8	Q12188	680 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	ERS1	P17261	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	SLS1	P42900	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	ELG1	Q12050	791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	CDC34	P14682	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	YKL077W	P36081	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	HXT13	P39924	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	BOI2	P39969	1040 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	MAD1	P40957	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	GCV1	P48015	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	HXT17	P53631	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	HXT15	P54854	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	MEC3	Q02574	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	HDA2	Q06629	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	SAC7	P17121	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	CLN2	P20438	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	RRM3	P38766	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	MRL1	Q06815	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	PHM7	Q12252	991 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	TAF13	P11747	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	YNR014W	P53719	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	NSG2	P53898	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	EEB1	Q02891	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	TDA6	Q06466	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	GAS5	Q08193	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	VAC8	P39968	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	BUD9	P53226	547 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	DSE4	P53753	1117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	SIW14	P53965	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	ROD1	Q02805	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
ATG10	YLL042C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	YGR053C	P53234	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	FAR11	P53917	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG10	YLL042C	AFG2	P32794	780 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	SPO74	P45819	413 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	ENT3	P47160	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	NCE103	P53615	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	EST2	Q06163	884 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	MKK2	P32491	506 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	RER2	P35196	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	ADD66	P36040	267 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	YDR215C	Q12240	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	AI3	P03877	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG10	YLL042C	SFA1	P32771	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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