RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	FBP1	P09201	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ACE2	P21192	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	SPT21	P35209	758 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	YHL017W	P38745	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	UBP9	P39967	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	VID28	P40547	921 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ARP5	P53946	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	VPS30	Q02948	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	PEX29	Q03370	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	DSE3	Q08729	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	ISW2	Q08773	1120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RLF2	Q12495	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FMP46	YKR049C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SRS2	P12954	1174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CBP3	P21560	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	DIT2	P21595	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SEC20	P28791	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	VPS45	P38932	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	AKR1	P39010	764 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CSM2	P40465	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YJL007C	P47080	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SRF1	Q12516	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TTI1	P36097	1038 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SPR3	P41901	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	LSB1	P53281	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	JIP4	Q03361	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YML037C	Q03703	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	UBX5	Q06682	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	GSC2	P40989	1895 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RAD18	P10862	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PCT1	P13259	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ASF1	P32447	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ASH1	P34233	588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	MCD4	P36051	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RXT2	P38255	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ERG7	P38604	731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	GPB2	P39717	880 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TPM2	P40414	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PCI8	P40512	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CTF18	P49956	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YAF9	P53930	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	ELG1	Q12050	791 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PKC1	P24583	1151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YKR018C	P36114	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	BUD6	P41697	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	EPL1	P43572	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YGL138C	P53122	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	FAR11	P53917	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	VPS20	Q04272	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CEX1	Q12453	761 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CIT1	P00890	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	IXR1	P33417	597 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TGL1	P34163	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	NPA3	P47122	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	NCS6	P53088	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	SPH1	Q06160	661 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	GUD1	Q07729	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	CDC6	P09119	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FMP46	YKR049C	BIK1	P11709	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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