RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W PUN1Q06991 263 aa5.51□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W ISC10P32645 267 aa5.5□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W RRM3P38766 723 aa5.5□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W THI12P42883 340 aa5.49□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W THI5P43534 340 aa5.49□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W THI11P47183 340 aa5.49□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W THI13Q07748 340 aa5.49□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W YOR296WQ08748 1289 aa5.49□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W DYS1P38791 387 aa5.48□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W SUB1P54000 292 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W ALO1P54783 526 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W SPC42P36094 363 aa5.47□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W LDH1P38139 375 aa5.47□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W CAT8P39113 1433 aa5.47□□□□□ -1.53
PIR3YKL163W AI3P03877 415 aa5.46□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W GIP1P38229 639 aa5.46□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W NUG1P40010 520 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W FAR11P53917 953 aa5.46□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SRS2P12954 1174 aa5.45□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W TED1P40533 473 aa5.45□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W YJL181WP46987 611 aa5.45□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W RTS3P53289 263 aa5.45□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W HAT1Q12341 374 aa5.45□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SAC7P17121 654 aa5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W MSN1P22148 382 aa5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W MAC1P35192 417 aa5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W OCA5P38738 679 aa5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W STM1P39015 273 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W NNF1P47149 201 aa5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W YAF9P53930 226 aa5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W USO1P25386 1790 aa5.44□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W VPS72Q03388 795 aa5.43□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SEC20P28791 383 aa5.42□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W BOI1P38041 980 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W ISW1P38144 1129 aa5.42□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W GIP2P40036 548 aa5.42□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W YIL165CP40446 119 aa5.42□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W PPT1P53043 513 aa5.42□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W PNP1Q05788 311 aa5.42□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa5.41□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W OMA1P36163 345 aa5.41□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W IPL1P38991 367 aa5.41□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SVF1Q05515 481 aa5.41□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.41□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SFA1P32771 386 aa5.4□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W SLP1Q12232 587 aa5.4□□□□□ -1.54
PIR3YKL163W KTR2P33550 425 aa5.39□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W HXT8P40886 569 aa5.39□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W INP52P50942 1183 aa5.39□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W HAP1P0CE41 1502 aa5.38□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W RSC2Q06488 889 aa5.38□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W TYS1P36421 394 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W FIR1P40020 876 aa5.37□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W INP51P40559 946 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W RGD2P43556 714 aa5.37□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W IML1P47170 1584 aa5.37□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W TRP3P00937 484 aa5.36□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W RPB10P22139 70 aa5.36□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W COQ2P32378 372 aa5.36□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W TFA2P36145 328 aa5.36□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W YJR008WP47085 338 aa5.36□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W APC11Q12157 165 aa5.36□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W YBT1P32386 1661 aa5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W RSC6P25632 483 aa5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W RRP14P36080 434 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W AIM46P38885 310 aa5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W OSW7P43611 510 aa5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W ATG36P46983 293 aa5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W YLR122CQ12312 125 aa5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W LSO1Q3E827 93 aa5.35□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W VMR1P38735 1592 aa5.34□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W YKR073CP36153 106 aa5.34□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W PAN5P38787 379 aa5.34□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W AKR1P39010 764 aa5.34□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W BOL3P39724 118 aa5.34□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W ALD3P54114 506 aa5.34□□□□□ -1.55
PIR3YKL163W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W SWE1P32944 819 aa5.33□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W KAE1P36132 386 aa5.33□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W BIO5P53744 561 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W FUR4P05316 633 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PIR3YKL163W TOM20P35180 183 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms