RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C MYO3P36006 1272 aa21.46■■□□□ 1.03
YKL036CYKL036C AAP1P37898 856 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
YKL036CYKL036C UBP9P39967 754 aa21.46■■□□□ 1.03
YKL036CYKL036C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data21.46■■□□□ 1.03not detected
YKL036CYKL036C YKR018CP36114 725 aa21.45■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C ICL2Q12031 575 aa21.45■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C MXR1P40029 184 aa21.44■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C FOL1P53848 824 aa21.43■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C ALD6P54115 500 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C RAD18P10862 487 aa21.42■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data21.42■■□□□ 1.02not detected
YKL036CYKL036C MET7Q08645 548 aa21.42■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C VPS62P53285 467 aa21.41■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C VPS30Q02948 557 aa21.41■■□□□ 1.02
YKL036CYKL036C CDC19P00549 500 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C TPM1P17536 199 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data21.39■■□□□ 1.01not detected
YKL036CYKL036C RER2P35196 286 aa21.38■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C VPS45P38932 577 aa21.38■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C UTR4P32626 227 aa21.37■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C PHO88P38264 188 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C DUS4Q06063 367 aa21.37■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C LDH1P38139 375 aa21.36■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C NUC1P08466 329 aa21.35■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C YGR125WP53273 1036 aa21.35■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C HDA1P53973 706 aa21.35■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C RGT1P32862 1170 aa21.34■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C TOM71P38825 639 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C YOR131CQ12486 218 aa21.34■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C IMP2'P32351 346 aa21.33■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C SRP40P32583 406 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C BRN1P38170 754 aa21.33■■□□□ 1.01
YKL036CYKL036C SAM1P10659 382 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
YKL036CYKL036C PTK2P47116 818 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
YKL036CYKL036C BUL2Q03758 920 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
YKL036CYKL036C CSC1Q06538 782 aa21.32■■□□□ 1
YKL036CYKL036C MAK31P23059 88 aa21.31■■□□□ 1
YKL036CYKL036C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
YKL036CYKL036C TGL1P34163 548 aa21.3■■□□□ 1
YKL036CYKL036C CIC1P38779 376 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
YKL036CYKL036C BRE5P53741 515 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
YKL036CYKL036C SUT2Q12286 268 aa21.3■■□□□ 1
YKL036CYKL036C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
YKL036CYKL036C ALG2P43636 503 aa21.28■■□□□ 1
YKL036CYKL036C YJR107WP47145 328 aa21.28■■□□□ 1
YKL036CYKL036C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
YKL036CYKL036C SPH1Q06160 661 aa21.28■■□□□ 1
YKL036CYKL036C VPS13Q07878 3144 aa21.28■■□□□ 1
YKL036CYKL036C ECM29P38737 1868 aa21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C PEP3P27801 918 aa21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C AIM21P40563 679 aa21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C PRY3P47033 881 aa21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C LSB1P53281 241 aa21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C GCR2Q01722 534 aa21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C TFC6Q06339 672 aa21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C PGA3Q12746 312 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
YKL036CYKL036C CSM2P40465 213 aa21.26■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C EST2Q06163 884 aa21.26■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C SUE1Q06524 206 aa21.25■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C ISW2Q08773 1120 aa21.25■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C SLD5Q03406 294 aa21.24■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C SEC20P28791 383 aa21.23■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C SHP1P34223 423 aa21.23■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C VPS29P38759 282 aa21.23■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C HXT17P53631 564 aa21.23■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C MAL31P38156 614 aa21.22■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C SRP54P20424 541 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C MCR1P36060 302 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C UIP5P36137 443 aa21.21■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C MDM1Q01846 1127 aa21.21■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C MAM3Q12296 706 aa21.21■□□□□ 0.99
YKL036CYKL036C AFG3P39925 761 aa21.2■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C ECM30Q06673 1274 aa21.2■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C GUD1Q07729 489 aa21.19■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C ERP3Q12403 225 aa21.19■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C BCS1P32839 456 aa21.18■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C HXT13P39924 564 aa21.18■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C VPS53P47061 822 aa21.18■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C DBP1P24784 617 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C MCM4P30665 933 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C DLD1P32891 587 aa21.17■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C SIS2P36024 562 aa21.17■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C RKM4Q12504 494 aa21.17■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C DSE3Q08729 430 aa21.16■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C FMS1P50264 508 aa21.15■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C YOR111WQ99210 232 aa21.15■□□□□ 0.98
YKL036CYKL036C SEC8P32855 1065 aa21.14■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C TPM2P40414 161 aa21.14■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C CLA4P48562 842 aa21.14■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C YPL034WQ03083 165 aa21.14■□□□□ 0.97
YKL036CYKL036C TKL1P23254 680 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.8 ms