RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	AKR1	P39010	764 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	FAR11	P53917	953 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	ATE1	P16639	503 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	COQ2	P32378	372 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	MGE1	P38523	228 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	RSM26	P47141	266 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	PEX13	P80667	386 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	YIG1	Q08956	461 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	REC8	Q12188	680 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YGL239C	YGL239C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YKL077W	P36081	392 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	FAA3	P39002	694 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	GCV1	P48015	400 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	NCE103	P53615	221 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	ULP1	Q02724	621 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YLL054C	Q12244	843 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	MCM2	P29469	868 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	SQT1	P35184	431 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	SHU2	P38957	223 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	MEC3	Q02574	474 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YOR223W	Q12015	292 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	MSH3	P25336	1018 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	GPT2	P36148	743 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	EXO5	P38289	585 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	SLS1	P42900	643 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	GIC2	Q06648	383 aa		3.44	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.44	□□□□□ -1.86	not detected
YGL239C	YGL239C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	CHS2	P14180	963 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	SEC8	P32855	1065 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	KAE1	P36132	386 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	SAF1	P38352	637 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	PEX28	P38848	579 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YPL109C	Q02981	657 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	ADI1	Q03677	179 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	SPR28	Q04921	423 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	AVO1	Q08236	1176 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YLR122C	Q12312	125 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	ASF1	P32447	279 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	PEP7	P32609	515 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	NEM1	P38757	446 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	FYV10	P40492	516 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	MRPS18	P42847	217 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	SPO74	P45819	413 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YGR045C	P53229	120 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YGR122W	P53272	402 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	RAD2	P07276	1031 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	ATG14	P38270	344 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	PIC2	P40035	300 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YJR107W	P47145	328 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YGR130C	P53278	816 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	YNR063W	P53749	607 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGL239C	YGL239C	TRP3	P00937	484 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	CYC8	P14922	966 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	XKS1	P42826	600 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	YGL140C	P53120	1219 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	MCD1	Q12158	566 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	NFS1	P25374	497 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	YAR028W	P39548	234 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	MMM1	P41800	426 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	MED7	Q08278	222 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	CYC7	P00045	113 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.38	□□□□□ -1.87	not detected
YGL239C	YGL239C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YGL239C	YGL239C	MAC1	P35192	417 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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