RNA–Protein interactions for RNA: YBL055C

YBL055C, Transcript of 3'-->5' exonuclease and endonuclease with a possible role in apoptosis, yeast

Gene YBL055C, Length 1,257 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL055C	YBL055C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	UGA4	P32837	571 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	PET112	P33893	541 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	RDH54	P38086	958 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	YLL054C	Q12244	843 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YBL055C	YBL055C	MSH3	P25336	1018 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	PEP7	P32609	515 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	YKL077W	P36081	392 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	PEX28	P38848	579 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	NEO1	P40527	1151 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	DSE4	P53753	1117 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	FAR11	P53917	953 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	MEC3	Q02574	474 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	VPS16	Q03308	798 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	GNP1	P48813	663 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	RKM2	Q03942	479 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	ELG1	Q12050	791 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	CDC34	P14682	295 aa		5	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	SFA1	P32771	386 aa		5	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TED1	P40533	473 aa		5	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	SIW14	P53965	281 aa		5	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
YBL055C	YBL055C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	BOI2	P39969	1040 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	MAD1	P40957	749 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	YFL066C	P43538	392 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	DUT1	P33317	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	NEM1	P38757	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	XKS1	P42826	600 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	YNR014W	P53719	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	PEX13	P80667	386 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	HXT13	P39924	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	YGR053C	P53234	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	HXT17	P53631	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	HXT15	P54854	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	HDA2	Q06629	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	PHM7	Q12252	991 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YBL055C	YBL055C	AI3	P03877	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	GCR1	P07261	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	ADD66	P36040	267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	RRM3	P38766	723 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	MRL1	Q06815	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	ERS1	P17261	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	RAD27	P26793	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	YJL049W	P47048	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	BUD9	P53226	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	SLS1	P42900	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	NSG2	P53898	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	EST2	Q06163	884 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	TDA6	Q06466	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	RSC6	P25632	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	HSE1	P38753	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	NNF1	P47149	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	NCE103	P53615	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	THI72	Q08579	599 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	LAP2	Q10740	671 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	LYP1	P32487	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	MKK2	P32491	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	ATG14	P38270	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	OCA5	P38738	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	YAR028W	P39548	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	VAC8	P39968	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	VPS53	P47061	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	EEB1	Q02891	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	NNK1	P36003	928 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YBL055C	YBL055C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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