RNA–Protein interactions for RNA: YBL006W-A

YBL006W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YBL006W-A, Length 150 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL006W-AYBL006W-A PCL8Q08966 492 aa5.32□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A DCS2Q12123 353 aa5.32□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A TRS33Q99394 268 aa5.32□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A MET6P05694 767 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A RPS9BP05755 195 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A GPA1P08539 472 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A RGP1P16664 663 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A GAP1P19145 602 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A ACE2P21192 770 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A MSM1P22438 575 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A PRE8P23639 250 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A RPL8BP29453 256 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A STV1P37296 890 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A RFT1P38206 574 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A RXT2P38255 430 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A GDE1Q02979 1223 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A CRF1Q04930 467 aa5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A ETT1Q08421 412 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A HXK1P04806 485 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SRM1P21827 482 aa5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A CHS3P29465 1165 aa5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A MCM4P30665 933 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A YER130CP39959 443 aa5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A YPT11P48559 417 aa5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A VPS4P52917 437 aa5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A FOL1P53848 824 aa5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SQS1P53866 767 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SSL2Q00578 843 aa5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A TRM44Q02648 567 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A VMS1Q04311 632 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.3□□□□□ -1.56not detected
YBL006W-AYBL006W-A MYO1P08964 1928 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A NUC1P08466 329 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A KIN1P13185 1064 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data5.29□□□□□ -1.56not detected
YBL006W-AYBL006W-A SRP54P20424 541 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A ADP1P25371 1049 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A URA1P28272 314 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A YBL028CP38202 106 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A MDM1Q01846 1127 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A VPS30Q02948 557 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A GIS4Q04233 774 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SGD1Q06132 899 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SKG3Q06315 1026 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A CSC1Q06538 782 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A DSE3Q08729 430 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A PTC5Q12511 572 aa5.29□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A CIT1P00890 479 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A ATE1P16639 503 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A ASF1P32447 279 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A GLC3P32775 704 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A CST26P38226 397 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A SLI15P38283 698 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A TOM71P38825 639 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A KEL1P38853 1164 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A FYV10P40492 516 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A YGL138CP53122 345 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A FPK1P53739 893 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A FAR11P53917 953 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A AAD16Q02895 342 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A EIS1Q05050 843 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A NBL1Q3E7Y6 73 aa5.28□□□□□ -1.56
YBL006W-AYBL006W-A CBP1P07252 654 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A TAF13P11747 167 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A HPR1P17629 752 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A SAM2P19358 384 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A RAD53P22216 821 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A GSY2P27472 705 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A SRP40P32583 406 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A YKT6P36015 200 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A MIC60P36112 540 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A MRPL10P36520 322 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A FET4P40988 552 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A CUE3P53137 624 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A YGR117CP53270 476 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A TIM50Q02776 476 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A SMD2Q06217 110 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A YPR148CQ06523 435 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A YOR296WQ08748 1289 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A CEX1Q12453 761 aa5.27□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A TUS1Q06412 1307 aa5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A TUB2P02557 457 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A MCM3P24279 971 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A BMH1P29311 267 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A MCM2P29469 868 aa5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A RRM3P38766 723 aa5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A VPS45P38932 577 aa5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A CCT3P39077 534 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A PES4P39684 611 aa5.26□□□□□ -1.57
YBL006W-AYBL006W-A LYS14P40971 790 aa5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.7 ms