RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	SLIT3	O75094	1523 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	GC	P02774	474 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	HOXC9	P31274	260 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	IP6K1	Q92551	441 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	IL16	Q14005	1332 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	PEAK1	Q9H792	1746 aa		13.21	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	NFE2L2	Q16236	605 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	NFAT5	O94916	1531 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	ALS2	Q96Q42	1657 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	SOX12	O15370	315 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	HMOX1	P09601	288 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	RIPK4	P57078	832 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	PXDN	Q92626	1479 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	FKBP8	Q14318	412 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	KDR	P35968	1356 aa		13.18	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	EYA1	Q99502	592 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TARBP2-208	ENST00000547541	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	ABCC6	O95255	1503 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	LTN1	O94822	1766 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	CPD	O75976	1380 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	GNAI1	P63096	354 aa		13.11	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TARBP2-208	ENST00000547541	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	NBPF4	Q96M43	638 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	TOM1	O60784	492 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	ERBB3	P21860	1342 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	COL18A1	P39060	1754 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.04	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	CHL1	O00533	1208 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	KIAA0232	Q92628	1395 aa		13.03	□□□□□ -0.32
TARBP2-208	ENST00000547541	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TARBP2-208	ENST00000547541	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33

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