RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 CPS1P31327 1500 aa14.04□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 NLRP6P59044 892 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 KCNA6P17658 529 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 BCL11AQ9H165 835 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.03□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.02□□□□□ -0.16
RABGEF1-208ENST00000510829 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.02□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 MBIPQ9NS73 344 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 IFT57Q9NWB7 429 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ADGRB2O60241 1585 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 PTPRUQ92729 1446 aa14.01□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C8orf34Q49A92 452 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TSPYL6Q8N831 410 aa14□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC4A3P48751 1232 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CFAP44Q96MT7 982 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 VAMP4O75379 141 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 MCM10Q7L590 875 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ABTB2Q8N961 1025 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 USP6P35125 1406 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF428Q96B54 188 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
RABGEF1-208ENST00000510829 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MIS18AQ9NYP9 233 aa13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ITSN1Q15811 1721 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 PSME1Q06323 249 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 C3P01024 1663 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.93□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 KRT24Q2M2I5 525 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXO3O43524 673 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF853P0CG23 659 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.92□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 FLT4P35916 1363 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 LNPKQ9C0E8 428 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 SLIT1O75093 1534 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 EYA1Q99502 592 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 SEC24BO95487 1268 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD45Q5TZF3 282 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 PTCH1Q13635 1447 aa13.9□□□□□ -0.18
RABGEF1-208ENST00000510829 GAS2L2Q8NHY3 880 aa13.89□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.89□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 SBNO1A3KN83 1393 aa13.89□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 USP31Q70CQ4 1352 aa13.88□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 CHL1O00533 1208 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 BECN1Q14457 450 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 AKAP12Q02952 1782 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 DIP2AQ14689 1571 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 SLC4A2P04920 1241 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 NECTIN2Q92692 538 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 HOXC9P31274 260 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 SMC5Q8IY18 1101 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 STK31Q9BXU1 1019 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 PIK3R4Q99570 1358 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 CHD1LQ86WJ1 897 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 APBB1O00213 710 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGEF10O15013 1369 aa13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms