RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, human

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	COL9A1	P20849	921 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	MCM5	P33992	734 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	KIF15	Q9NS87	1388 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TOP2B	Q02880	1626 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	JPH4	Q96JJ6	628 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NAIP	Q13075	1403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GLMN	Q92990	594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SMAP	O00193	183 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TTC13	Q8NBP0	860 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	RFX1	P22670	979 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	RFC5	P40937	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	QPCT	Q16769	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NDUFV2	P19404	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CBX1	P83916	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PRSS12	P56730	875 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GPR153	Q6NV75	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	HLA-C	Q95604	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	LHX6	Q9UPM6	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CUX1	P39880	1505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PTPRK	Q15262	1439 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FUBP1-211	ENST00000489495	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	OAT	P04181	439 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FUBP1-211	ENST00000489495	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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