RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 TPM3P06753 285 aa17.79■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 LUZP1Q86V48 1076 aa17.79■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 CFAP44Q96MT7 982 aa17.79■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 DDIT3P35638 169 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 KRBA2Q6ZNG9 492 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 ERC2O15083 957 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 FOSBP53539 338 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 FMNL2Q96PY5 1086 aa17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.77■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.77■□□□□ 0.44
SOGA3-201ENST00000465909 NRDCO43847 1150 aa17.77■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 DRC1Q96MC2 740 aa17.77■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 RASSF4Q9H2L5 321 aa17.77■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 LMAN1P49257 510 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 NRBP1Q9UHY1 535 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 UVSSAQ2YD98 709 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 TSPYL1Q9H0U9 437 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 SMTNL1A8MU46 457 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 KIAA1524Q8TCG1 905 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 CTNNA3Q9UI47 895 aa17.76■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 SLFN14P0C7P3 912 aa17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 GPRASP1Q5JY77 1395 aa17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 USP26Q9BXU7 913 aa17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 SDSP20132 328 aa17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 TTLL5Q6EMB2 1281 aa17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa17.75■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 HECW1Q76N89 1606 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 CCDC34Q96HJ3 373 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 ZDHHC9Q9Y397 364 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 MX1P20591 662 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 MLECQ14165 292 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 TNMDQ9H2S6 317 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.74■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 HMOX1P09601 288 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 TMCO3Q6UWJ1 677 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 KIF18AQ8NI77 898 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 KLHL34Q8N239 644 aa17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 UBXN4Q92575 508 aa17.72■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 DEF6Q9H4E7 631 aa17.72■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 TPM4P67936 248 aa17.71■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 NUP62CLQ9H1M0 184 aa17.71■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.71■□□□□ 0.43
SOGA3-201ENST00000465909 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa17.7■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ANKRD65E5RJM6 399 aa17.7■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa17.7■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 GYS2P54840 703 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 KDM5CP41229 1560 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 MAP3K11Q16584 847 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 LEKR1Q6ZMV7 388 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 TRIM66O15016 1216 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 STK26Q9P289 416 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ROCK1Q13464 1354 aa17.69■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 TTC22Q5TAA0 569 aa17.68■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 SKILP12757 684 aa17.68■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 E2F4Q16254 413 aa17.68■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 ANO6Q4KMQ2 910 aa17.68■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 FAM173BQ6P4H8 233 aa17.68■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 KMT5BQ4FZB7 885 aa17.68■□□□□ 0.42
SOGA3-201ENST00000465909 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms