RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.76□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 EPM2AB3EWF7 344 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 SHISA8B8ZZ34 492 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 ARNTLO00327 626 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 C6P13671 934 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 RFX1P22670 979 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 LBX1P52954 281 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 PURAQ00577 322 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 KRT33BQ14525 404 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 RGL3Q3MIN7 710 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF524Q96C55 264 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 CSRNP2Q9H175 543 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 POTEB2H3BUK9 544 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 ELFN1P0C7U0 828 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 RBM3P98179 157 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 PLAURQ03405 335 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 LAMC2Q13753 1193 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 FOXD1Q16676 465 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 XKR6Q5GH73 641 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 ATG9BQ674R7 924 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGAP17Q68EM7 881 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 CSRNP3Q8WYN3 585 aa-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
SNORD54-201ENST00000459159 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 NEURL4Q96JN8 1562 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 ACAP1Q15027 740 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 USP51Q70EK9 711 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 PTF1AQ7RTS3 328 aa-0.79□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 ADAMTS2O95450 1211 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 NTN1O95631 604 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 NCLP19338 710 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KRT85P78386 507 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KRT76Q01546 638 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 VWA2Q5GFL6 755 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 SERINC5Q86VE9 423 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 TMIGD2Q96BF3 282 aa-0.8□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM66O15016 1216 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 EGFRP00533 1210 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 USP43Q70EL4 1123 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 STAG1Q8WVM7 1258 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 CRELD1Q96HD1 420 aa-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 MEGF11A6BM72 1044 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 SP1P08047 785 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KRT5P13647 590 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 ASIPP42127 132 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 WASP42768 502 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 RIPPLY3P57055 190 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 DMRTA1Q5VZB9 504 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM42Q8IWZ5 723 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 OSCARQ8IYS5 282 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP-0.82□□□□□ -2.546e-24■■□□□ 11.6
SNORD54-201ENST00000459159 BRWD3Q6RI45 1802 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 AKAP9Q99996 3911 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 DMDP11532 3685 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 PCSK5Q92824 1860 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 POTEIP0CG38 1075 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC157Q569K6 752 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM65Q6PJ69 517 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 WFDC3Q8IUB2 231 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 TMEFF1Q8IYR6 380 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 RTN4RQ9BZR6 473 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KCNN2Q9H2S1 579 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KCNK12Q9HB15 430 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 KCNK4Q9NYG8 393 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD54-201ENST00000459159 ACACAQ13085 2346 aa-0.83□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms