RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440184.1

CBX1P1-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 1, humanhuman

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Gene CBX1P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P1-201ENST00000440184 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.63□□□□□ -1.19
CBX1P1-201ENST00000440184 USP17L8P0C7I0 530 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P1-201ENST00000440184 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CBX1P1-201ENST00000440184 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.62□□□□□ -1.19
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CBX1P1-201ENST00000440184 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P1-201ENST00000440184 CD109Q6YHK3 1445 aa7.61□□□□□ -1.19
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CBX1P1-201ENST00000440184 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P1-201ENST00000440184 CTHP32929 405 aa7.56□□□□□ -1.2
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CBX1P1-201ENST00000440184 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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CBX1P1-201ENST00000440184 TRIM32Q13049 653 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P1-201ENST00000440184 MCM6Q14566 821 aa7.55□□□□□ -1.2
CBX1P1-201ENST00000440184 NR6A1Q15406 480 aa7.55□□□□□ -1.2
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CBX1P1-201ENST00000440184 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CBX1P1-201ENST00000440184 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa7.53□□□□□ -1.2
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CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.51□□□□□ -1.21
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CBX1P1-201ENST00000440184 FOXJ1Q92949 421 aa7.48□□□□□ -1.21
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CBX1P1-201ENST00000440184 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 EEA1Q15075 1411 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 WNT7AO00755 349 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 NBPF14Q5TI25 921 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 FANCAO15360 1455 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.47□□□□□ -1.21
CBX1P1-201ENST00000440184 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CBX1P1-201ENST00000440184 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1P1-201ENST00000440184 POM121Q96HA1 1249 aa7.46□□□□□ -1.22
CBX1P1-201ENST00000440184 PREX1Q8TCU6 1659 aa7.45□□□□□ -1.22
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