RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRB3O60242 1522 aa9.35□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK-7P63135 1459 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D12O60347 775 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 RGL3Q3MIN7 710 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 SYNMO15061 1565 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP13Q86W25 1043 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 IFT172Q9UG01 1749 aa9.34□□□□□ -0.91
CTPS1-201ENST00000372616 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 MYOM2P54296 1465 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 G3V3G9 751 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 MLECQ14165 292 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 LAMC1P11047 1609 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.33□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 OCEL1Q9H607 264 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYM3Q14202 1370 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 PPLO60437 1756 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 MADDQ8WXG6 1647 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K7O43318 606 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 CLCN1P35523 988 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.31□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 SNRKQ9NRH2 765 aa9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 IDI1Q13907 227 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.29□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 ZFYVE9O95405 1425 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 RAD21O60216 631 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 NFKBIBQ15653 356 aa9.27□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP1Q9C000 1473 aa9.27□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 C3P01024 1663 aa9.27□□□□□ -0.92
CTPS1-201ENST00000372616 TNRQ92752 1358 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 COG6Q9Y2V7 657 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO41Q8TF61 875 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3C2GO75747 1445 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 IQGAP1P46940 1657 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 EVX2Q03828 476 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 PLCG2P16885 1265 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 RETREG2Q8NC44 543 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.23□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 BECN1Q14457 450 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 NGEFQ8N5V2 710 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CTPS1-201ENST00000372616 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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