RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.44■□□□□ 0.06
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PTPRK-207ENST00000368226 RABEP1Q15276 862 aa15.34■□□□□ 0.05
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PTPRK-207ENST00000368226 METTL24Q5JXM2 366 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRK-207ENST00000368226 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRK-207ENST00000368226 TXLNAP40222 546 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRK-207ENST00000368226 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRK-207ENST00000368226 USP5P45974 858 aa15.32■□□□□ 0.04
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