RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 S1PR4O95977 384 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTK7Q13308 1070 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAP7D1Q3KQU3 841 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB33Q86T24 672 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 BAP1Q92560 729 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPN5P54829 565 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 EML3Q32P44 896 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF511Q8NB15 262 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 RGS22Q8NE09 1264 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOXJ1Q92949 421 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CARD14Q9BXL6 1004 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 RASA1P20936 1047 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC01559Q495D7 138 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ERFEQ4G0M1 354 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLAIN2Q9P270 581 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ESPNB1AK53 854 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 DKK1O94907 266 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLDN10P78369 228 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM50Q86XT4 487 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 OGFOD1Q8N543 542 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 NOD1Q9Y239 953 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SSFA2P28290 1259 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP1A2P50993 1020 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SH3BP2P78314 561 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 DPYDQ12882 1025 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 AGERQ15109 404 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF20Q5VTR2 975 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 TXNDC2Q86VQ3 553 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIX5Q8N196 739 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 LARGE2Q8N3Y3 721 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM200AQ8TCP9 573 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDH10Q9P2E7 1040 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 GTF2IP78347 998 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SWI5Q1ZZU3 235 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEPT12Q8IYM1 358 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 MTMR7Q9Y216 660 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF223E7ERA6 249 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 POTEGQ6S5H5 508 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC125Q86Z20 511 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP2B4P23634 1241 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 SKOR1P84550 965 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCNC4Q03721 635 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM32Q13049 653 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC27Q2M243 656 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1orf216Q8TAB5 229 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEC13P55735 322 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 WNT7BP56706 349 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 USP4Q13107 963 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 OCLNQ16625 522 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-655P-201ENST00000362858 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.3 ms