RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320225.9

RNPS1-202, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-202ENST00000320225 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 PKP1Q13835 747 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.93■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 GLI2P10070 1586 aa21.91■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 CDC45O75419 566 aa21.91■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 PTCH1Q13635 1447 aa21.9■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.9■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 GPT2Q8TD30 523 aa21.9■■□□□ 1.1
RNPS1-202ENST00000320225 EVC2Q86UK5 1308 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 NUCB2P80303 420 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 RABEP1Q15276 862 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 A0A1W2PP64 1363 aa21.89■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 MAP7D2Q96T17 732 aa21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.88■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 CABP2Q9NPB3 220 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 GGT6Q6P531 493 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 USP26Q9BXU7 913 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 VAMP4O75379 141 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 UQCRHP07919 91 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 ZNF428Q96B54 188 aa21.86■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.85■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.85■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 ABCC4O15439 1325 aa21.85■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.84■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.83■■□□□ 1.09
RNPS1-202ENST00000320225 ABCC3O15438 1527 aa21.83■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.83■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 FYB1O15117 783 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 TSPYL6Q8N831 410 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 MCM5P33992 734 aa21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 DYNC1I1O14576 645 aa21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 TTC22Q5TAA0 569 aa21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.79■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 PIK3C2BO00750 1634 aa21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 FCHSD2O94868 740 aa21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 DCTPP1Q9H773 170 aa21.77■■□□□ 1.08
RNPS1-202ENST00000320225 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 SYCE3A1L190 88 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.76■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 ZNF853P0CG23 659 aa21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 PRKAR2BP31323 418 aa21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.73■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 CFAP44Q96MT7 982 aa21.72■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 SDSP20132 328 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 ATP10DQ9P241 1426 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 NFE2L2Q16236 605 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 MBIPQ9NS73 344 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.71■■□□□ 1.07
RNPS1-202ENST00000320225 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-202ENST00000320225 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-202ENST00000320225 ZFYVE9O95405 1425 aa21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-202ENST00000320225 ST18O60284 1047 aa21.7■■□□□ 1.06
RNPS1-202ENST00000320225 IFT57Q9NWB7 429 aa21.69■■□□□ 1.06
RNPS1-202ENST00000320225 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.68■■□□□ 1.06
RNPS1-202ENST00000320225 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.2 ms