RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.64□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK19Q9BWU1 502 aa13.64□□□□□ -0.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.63□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.62□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.62□□□□□ -0.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 SLIT1O75093 1534 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 C3P01024 1663 aa13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP13.61□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.61□□□□□ -0.23
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RABGGTB-201ENST00000319942 WASLO00401 505 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
RABGGTB-201ENST00000319942 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 IFFO2Q5TF58 517 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TECPR2O15040 1411 aa13.57□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2R1AP30153 589 aa13.56□□□□□ -0.24
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RABGGTB-201ENST00000319942 CABP1Q9NZU7 370 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.56□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 MED14O60244 1454 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 PIK3R4Q99570 1358 aa13.55□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.53□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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RABGGTB-201ENST00000319942 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.52□□□□□ -0.24
RABGGTB-201ENST00000319942 NSD2O96028 1365 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGGTB-201ENST00000319942 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.51□□□□□ -0.25
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RABGGTB-201ENST00000319942 INSRP06213 1382 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGGTB-201ENST00000319942 PTCH1Q13635 1447 aa13.47□□□□□ -0.25
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RABGGTB-201ENST00000319942 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.45□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOM1P52179 1685 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JS52 829 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R37O75864 691 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 MTHFSP49914 203 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP7BP35670 1465 aa13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NUTM2FA1L443 756 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf37Q86TY3 774 aa13.42□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE3BQ13370 1112 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 COG3Q96JB2 828 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDCQ9Y266 331 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 CD163L1Q9NR16 1453 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ACEP12821 1306 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGGTB-201ENST00000319942 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
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