RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 TRAK2O60296 914 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.43■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 IL13P35225 146 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 COG3Q96JB2 828 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 SIRT1Q96EB6 747 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.41■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 NFE2L2Q16236 605 aa22.4■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.39■■□□□ 1.18
TSPAN17-201ENST00000298564 CPS1P31327 1500 aa22.39■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 TECPR2O15040 1411 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 NUTM2FA1L443 756 aa22.37■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 FSD2A1L4K1 749 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 LTKP29376 864 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 KIF16BQ96L93 1317 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN17-201ENST00000298564 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 TSPYL6Q8N831 410 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.32■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 LNPKQ9C0E8 428 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 VAMP4O75379 141 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ERBB4Q15303 1308 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 HSCBQ8IWL3 235 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 GNAI1P63096 354 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 MBIPQ9NS73 344 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ACEP12821 1306 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM83GA6ND36 823 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 IFT57Q9NWB7 429 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF428Q96B54 188 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 DCTN1Q14203 1278 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 C3P01024 1663 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF853P0CG23 659 aa22.27■■□□□ 1.16
TSPAN17-201ENST00000298564 AKAP12Q02952 1782 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 ITSN1Q15811 1721 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 CLCN1P35523 988 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 SMC5Q8IY18 1101 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 CFAP44Q96MT7 982 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 MRE11P49959 708 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 SOX12O15370 315 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 EID1Q9Y6B2 187 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 PTPRUQ92729 1446 aa22.22■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 ESPNB1AK53 854 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPAN17-201ENST00000298564 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 USP6P35125 1406 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 NUCB1Q02818 461 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN17-201ENST00000298564 PTCH1Q13635 1447 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms