RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Stk31Q99MW1 1018 aa25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa25.91■■□□□ 1.74
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Anp32aO35381 247 aa25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 NudcO35685 332 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hoxc9P09633 260 aa25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CenpbP27790 599 aa25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Farp2Q91VS8 1065 aa25.88■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CastP51125 788 aa25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MpripP97434 1024 aa25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kcnh5Q920E3 988 aa25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trpm3Q5F4S9 1721 aa25.87■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mcm10Q0VBD2 885 aa25.86■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atf3Q60765 181 aa25.86■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kcnh8P59111 1102 aa25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cabp2Q9JLK4 216 aa25.85■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gnai1B2RSH2 354 aa25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim58Q5NCC9 485 aa25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gnai3Q9DC51 354 aa25.84■■□□□ 1.73
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eya1P97767 591 aa25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AampJ3QN89 436 aa25.82■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 DccP70211 1447 aa25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sos1Q62245 1319 aa25.81■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pip4k2bQ80XI4 416 aa25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Apbb1Q9QXJ1 710 aa25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tet3Q8BG87 1668 aa25.8■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccne1Q61457 408 aa25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Znf521Q6KAS7 1311 aa25.79■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TatQ8QZR1 454 aa25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zmym3Q9JLM4 1370 aa25.78■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kdm6aO70546 1401 aa25.77■■□□□ 1.72
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fmnl2A2APV2 1086 aa25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Arfgef2A2A5R2 1792 aa25.76■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Amigo3Q8C2S7 508 aa25.75■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Polr3glQ8R0C0 218 aa25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gli3Q61602 1583 aa25.74■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TnrQ8BYI9 1358 aa25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 GnpatP98192 678 aa25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem132eQ6IEE6 982 aa25.73■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plin1Q8CGN5 517 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pank1Q8K4K6 548 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 HypkQ9CR41 129 aa25.71■■□□□ 1.71
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dzip1Q8BMD2 852 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc60Q8C4J0 545 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim26Q99PN3 545 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnajc10Q9DC23 793 aa25.7■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vamp4O70480 141 aa25.69■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bcl9lQ67FY2 1494 aa25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abca15E9PWH4 1668 aa25.68■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dixdc1Q80Y83 711 aa25.67■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Myo5bP21271 1818 aa25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Brinp3Q499E0 766 aa25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nid2O88322 1403 aa25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ecm2Q5FW85 670 aa25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Supt16hQ920B9 1047 aa25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp16Q99LG0 825 aa25.65■■□□□ 1.7
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tspyl2Q7TQI8 677 aa25.63■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Amotl1Q9D4H4 968 aa25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nsd3Q6P2L6 1439 aa25.6■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp10bB1AWN4 1474 aa25.59■■□□□ 1.69
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm6268A2A3U9 297 aa25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc4a3P16283 1227 aa25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Card10P58660 1021 aa25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igsf1Q7TQA1 1317 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Simc1E9Q6E9 1354 aa25.56■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Amotl2Q8K371 772 aa25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klhdc4Q921I2 584 aa25.55■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 FocadA2AKG8 1798 aa25.54■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cadps2Q8BYR5 1297 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Abcc12Q80WJ6 1366 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm21698A0A087WQP8 267 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm21671G3UY31 267 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q3UPC7 1272 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 TkfcQ8VC30 578 aa25.53■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif24Q6NWW5 1356 aa25.52■■□□□ 1.68
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.4 ms