RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map7O88735 730 aa22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf316Q6PGE4 1016 aa22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q3UPC7 1272 aa22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plppr3Q7TPB0 716 aa22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q3UJC8 639 aa22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wwc1Q5SXA9 1104 aa22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MvpQ9EQK5 861 aa22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Armcx1Q9CX83 456 aa22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slit2Q9R1B9 1521 aa22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abcc10Q8R4P9 1501 aa22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AU019823E9PUQ3 292 aa22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SkilQ60665 675 aa22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col16a1Q8BLX7 1580 aa22.89■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif4a2P10630 407 aa22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 C5P06684 1680 aa22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd44B2RXR6 993 aa22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stk31Q99MW1 1018 aa22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ubr1O70481 1757 aa22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scn7aB1AYL1 1681 aa22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Als2Q920R0 1651 aa22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6268A2A3U9 297 aa22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pik3c2aQ61194 1686 aa22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rabep1O35551 862 aa22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cluap1Q8R3P7 413 aa22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cabp2Q9JLK4 216 aa22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bcl11aQ9QYE3 773 aa22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sptbn5F6UCX4 1208 aa22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rad17Q6NXW6 688 aa22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bcl9Q9D219 1425 aa22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf330Q922H9 316 aa22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmco5bQ80X59 307 aa22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cetn4Q8K4K1 168 aa22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptpn23Q6PB44 1692 aa22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp16Q99LG0 825 aa22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tet3Q8BG87 1668 aa22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mcm10Q0VBD2 885 aa22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif18aQ91WD7 886 aa22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map2P20357 1828 aa22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LifrP42703 1092 aa22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aldh1l2Q8K009 923 aa22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trpm3Q5F4S9 1721 aa22.79■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pnmal2G3X9N3 661 aa22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nectin2P32507 530 aa22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pdlim2Q8R1G6 349 aa22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nutm1Q8BHP2 1126 aa22.76■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MpripP97434 1024 aa22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Htatsf1Q8BGC0 757 aa22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Camta1A2A891 1682 aa22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cgnl1Q6AW69 1298 aa22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chl1P70232 1209 aa22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif24Q6NWW5 1356 aa22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PtprvP70289 1705 aa22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ric3Q8BPM6 367 aa22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dennd6aQ8BH65 605 aa22.7■■□□□ 1.23
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 DaxxO35613 739 aa22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trim27Q62158 513 aa22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aldh8a1Q8BH00 487 aa22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cog6Q8R3I3 657 aa22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FancaQ9JL70 1439 aa22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Idi1P58044 227 aa22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr63B2RY71 923 aa22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nlgn1Q99K10 843 aa22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igsf1Q7TQA1 1317 aa22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Parp14Q2EMV9 1817 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NgefQ8CHT1 710 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Klhdc4Q921I2 584 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tm6sf1P58749 370 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phf23Q8BSN5 401 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif2cQ922S8 721 aa22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ap3b2Q9JME5 1082 aa22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mcm2P97310 904 aa22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ecm2Q5FW85 670 aa22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ano8Q6PB70 1060 aa22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gcc1Q9D4H2 778 aa22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm10563F6WIE4 79 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.4 ms