RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 C3P01024 1663 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CHL1O00533 1208 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 AP5Z1O43299 807 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CAVIN2O95810 425 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PRR35P0CG20 571 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CHN1P15882 459 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ITGB6P18564 788 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 HSPA4P34932 840 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 IDUAP35475 653 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PCP4P48539 62 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CBX1P83916 185 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SEC23BQ15437 767 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 LRRC24Q50LG9 513 aa5.48□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF484Q5JVG2 852 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ZNF626Q68DY1 528 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SARM1Q6SZW1 724 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PLA2G4DQ86XP0 818 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 RFX6Q8HWS3 928 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 AFAP1Q8N556 730 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TSPYL6Q8N831 410 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ZNF366Q8N895 744 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 FSIP1Q8NA03 581 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CEP70Q8NHQ1 597 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 COG8Q96MW5 612 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 GPR78Q96P69 363 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TWNKQ96RR1 684 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TERF2IPQ9NYB0 399 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 POLKQ9UBT6 870 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 AKAP12Q02952 1782 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 RRHO14718 337 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SEPT4O43236 478 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 NEMFO60524 1076 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 HMMRO75330 724 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TUBB4AP04350 444 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PTMAP06454 111 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 CHMLP26374 656 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 SHC2P98077 582 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CTXN3Q4LDR2 81 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ALFQ53S48 1182 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ZNF813Q6ZN06 617 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 EXD3Q8N9H8 876 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 KIF18AQ8NI77 898 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ARRDC3Q96B67 414 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TBATAQ96M53 351 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 PYCARDQ9ULZ3 195 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 CRB1P82279 1406 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.47□□□□□ -1.53
TRDN-204ENST00000542443 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.47□□□□□ -1.53
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TRDN-204ENST00000542443 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 GRM8O00222 908 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 STX16O14662 325 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ATP8B1O43520 1251 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 CNTN5O94779 1100 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SGPL1O95470 568 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 ACP5P13686 325 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 KELP23276 732 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 MPGP29372 298 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PRKAR2BP31323 418 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 PNPLA4P41247 253 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.46□□□□□ -1.54
TRDN-204ENST00000542443 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.46□□□□□ -1.54
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