RNA–Protein interactions for RNA: YLR467W

YRF1-5, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-5, Length 5,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-5YLR467W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.51□□□□□ -1.05not detected
YRF1-5YLR467W ATG9Q12142 997 aa8.51□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W UGA3P26370 528 aa8.51□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W PUP2P32379 260 aa8.51□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W MAL33P38157 468 aa8.51□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W AIM9P40053 627 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W AUS1Q08409 1394 aa8.51□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W FYV10P40492 516 aa8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W NTH2P35172 780 aa8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W NKP1Q12493 238 aa8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W CNS1P33313 385 aa8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W APL4Q12028 832 aa8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W BUD14P27637 709 aa8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W NBL1Q3E7Y6 73 aa8.5□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W NUP133P36161 1157 aa8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W SEC27P41811 889 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W SWC3P31376 625 aa8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W PPH3P32345 308 aa8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data8.49□□□□□ -1.05not detected
YRF1-5YLR467W MUD2P36084 527 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W CIC1P38779 376 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W VAC14Q06708 880 aa8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W AAP1P37898 856 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W SEC9P40357 651 aa8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W SGM1P47166 707 aa8.49□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W CDC3P32457 520 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W TFC3P34111 1160 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W YLR287CQ05881 355 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W ADE17P38009 592 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W BOI2P39969 1040 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W YNL144CP53907 740 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W IMP2'P32351 346 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W ALF1P53904 254 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data8.48□□□□□ -1.05not detected
YRF1-5YLR467W YGR122WP53272 402 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W YDR338CQ05497 695 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data8.48□□□□□ -1.05 RIP-Chip
YRF1-5YLR467W MTF2P10849 440 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W OPY2Q06810 360 aa8.48□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W RAD4P14736 754 aa8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W PXA1P41909 870 aa8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W LAM1P38851 1228 aa8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W GRX3Q03835 250 aa8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W YMR085WP0CF18 432 aa8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W YOL057WQ08225 711 aa8.47□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W SSA2P10592 639 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W PGI1P12709 554 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
YRF1-5YLR467W SSE1P32589 693 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W HUL4P40985 892 aa8.46□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W GTR1Q00582 310 aa8.46□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W YPL150WQ12152 901 aa8.46□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W KCC4P25389 1037 aa8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W APL5Q08951 932 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W SFB2P53953 876 aa8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W EFM2P38347 419 aa8.45□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W HCA4P20448 770 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W EXO84P38261 753 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W SEC65P29478 273 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W MPH1P40562 993 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W CTF4Q01454 927 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W ERV41Q04651 352 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W MAD1P40957 749 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W ISW1P38144 1129 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W YSW1P38280 609 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W BET4Q00618 327 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W MIC19P43594 170 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W DNM1P54861 757 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W PKH1Q03407 766 aa8.44□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W YKR018CP36114 725 aa8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W CSC1Q06538 782 aa8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W GAL11P19659 1081 aa8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W DAS1P47005 663 aa8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W NUR1Q12066 484 aa8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W MIF2P35201 549 aa8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W VPS8P39702 1274 aa8.43□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W UFD2P54860 961 aa8.42□□□□□ -1.06
YRF1-5YLR467W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data8.42□□□□□ -1.06not detected
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