RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W AIM9P40053 627 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W YPQ2Q06328 317 aa3.44□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data3.44□□□□□ -1.86not detected
SSQ1YLR369W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W MCM1P11746 286 aa3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W TY1A-DR3Q12441 440 aa3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W SSA1P10591 642 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W AHP1P38013 176 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W UTP7P40055 554 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W ALA1P40825 983 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W JJJ2P46997 583 aa3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W ENT1Q12518 454 aa3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W TSC13Q99190 310 aa3.43□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W GPM1P00950 247 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W SWI5P08153 709 aa3.42□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W IRC24P40580 263 aa3.42□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W SRB8P25648 1427 aa3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W UBP1P25037 809 aa3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W PHO87P25360 923 aa3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W TAT1P38085 619 aa3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W KRE5P22023 1365 aa3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W YRF1-2P40105 1681 aa3.41□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W HAP4P14064 554 aa3.4□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W GAS4Q08271 471 aa3.4□□□□□ -1.86
SSQ1YLR369W IRE1P32361 1115 aa3.4□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W NTH2P35172 780 aa3.4□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W TTI1P36097 1038 aa3.4□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W ALO1P54783 526 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W CYT1P07143 309 aa3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W GAL2P13181 574 aa3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W ACS2P52910 683 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W RPS31P05759 152 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W LEU1P07264 779 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W PDI1P17967 522 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W PDC6P26263 563 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W MET1P36150 593 aa3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W RIA1P53893 1110 aa3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W PSH1Q12161 406 aa3.38□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W GCN2P15442 1659 aa3.37□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W FPS1P23900 669 aa3.37□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W TGL4P36165 910 aa3.37□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W PRY1P47032 299 aa3.37□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W YPL034WQ03083 165 aa3.37□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W ROM1P53046 1155 aa3.36□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W NGR1P32831 672 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W SCD5P34758 872 aa3.36□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W OMA1P36163 345 aa3.36□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W KTR7P40504 517 aa3.36□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W ALD2P47771 506 aa3.35□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W YTA6P40328 754 aa3.34□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W INP52P50942 1183 aa3.34□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W YNL165WP53891 406 aa3.34□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W RLF2Q12495 606 aa3.34□□□□□ -1.87
SSQ1YLR369W VAN1P23642 535 aa3.34□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W MLF3P32047 452 aa3.34□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W HXT5P38695 592 aa3.34□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W SPR3P41901 512 aa3.34□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W TRS33Q99394 268 aa3.34□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W NUP192P47054 1683 aa3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W PDC5P16467 563 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W RGP1P16664 663 aa3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W SSA4P22202 642 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W PUP1P25043 261 aa3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W MRPL16P38064 232 aa3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W UGA2P38067 497 aa3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W RPN11P43588 306 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W STB3Q12427 513 aa3.33□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W CPS1P27614 576 aa3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W SKP1P52286 194 aa3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W CWH41P53008 833 aa3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W ECM23Q02710 187 aa3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W Q0182Q9ZZW1 134 aa3.32□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W NPR2P39923 615 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W CAB1Q04430 367 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W RPC31P17890 251 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W SUV3P32580 737 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W MSC7P38694 644 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W DOT5P40553 215 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W AVT1P47082 602 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W CTH1P47976 325 aa3.31□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W UBX7P38349 436 aa3.3□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W HEH2Q03281 663 aa3.3□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SSQ1YLR369W KAP122P32767 1081 aa3.29□□□□□ -1.88
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