RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	PSH1	Q12161	406 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ERP4	Q12450	207 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SLA1	P32790	1244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	NFU1	P32860	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YHL050C	P38721	697 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YHR219W	P38900	624 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	UBP15	P50101	1230 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	WHI5	Q12416	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ESP1	Q03018	1630 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SRS2	P12954	1174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	MLF3	P32047	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SUV3	P32580	737 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YIR007W	P40566	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	IES1	P43579	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ROG3	P43602	733 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YNL165W	P53891	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	PNP1	Q05788	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	MYO4	P32492	1471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SCD5	P34758	872 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	BLI1	P35727	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
PAM18	YLR008C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	MNN1	P39106	762 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	BUD4	P47136	1447 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	UFD4	P33202	1483 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	OPI1	P21957	404 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	HXT5	P38695	592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	ACO2	P39533	789 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	UBP12	P39538	1254 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	YEN1	P40028	759 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	HOS4	P40480	1083 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	BUD6	P41697	788 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	THI12	P42883	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	THI5	P43534	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	THI11	P47183	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	TLG1	Q03322	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	RPN4	Q03465	531 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	CAB1	Q04430	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	THI13	Q07748	340 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAM18	YLR008C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	RPN12	P32496	274 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	ISC10	P32645	267 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MET1	P36150	593 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MAL31	P38156	614 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	YBR197C	P38306	217 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	PPX1	P38698	397 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MTO1	P53070	669 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	ATG1	P53104	897 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	YGL081W	P53156	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	KAR5	Q04746	504 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MDJ2	P42834	146 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	YJR107W	P47145	328 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	SMC4	Q12267	1418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	YOR1	P53049	1477 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	ITC1	P53125	1264 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	CUZ1	P53899	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MNL2	Q12205	849 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	KOG1	P38873	1557 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	SPP41	P38904	1435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	DNA2	P38859	1522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MRPL33	P20084	86 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MRPL16	P38064	232 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
PAM18	YLR008C	DIT1	P21623	536 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	MGE1	P38523	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	BOL3	P39724	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAM18	YLR008C	QDR2	P40474	542 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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