RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	JNM1	P36224	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	VAC8	P39968	578 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	TIM54	P47045	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	CTR9	P89105	1077 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	COG8	Q04632	607 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	TEA1	P47988	759 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	KEL2	P50090	882 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	SHE10	P53075	577 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	HOP2	P53187	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	PGC1	Q08959	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	SIT4	P20604	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	SAP190	P36123	1033 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	MEF2	P39677	819 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	RSC1	P53236	928 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	MCD1	Q12158	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	PAN1	P32521	1480 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUP133	YKR082W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ERP5	P38819	212 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	LAM1	P38851	1228 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	VTH1	P40438	1549 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	VTH2	P40890	1549 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ATF2	P53296	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RAD33	Q04231	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RGP1	P16664	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ARV1	Q06541	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MNL2	Q12205	849 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MSH3	P25336	1018 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	PEP12	P32854	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	HSM3	P38348	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MXR1	P40029	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	VPS16	Q03308	798 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YBT1	P32386	1661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MRE11	P32829	692 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YAP1801	P38856	637 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RIC1	P40395	1056 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TGL2	P54857	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TRS33	Q99394	268 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MDJ2	P42834	146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	BTN2	P53286	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SEC2	P17065	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MIC60	P36112	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ESL1	P40456	1118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ISW2	Q08773	1120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	COX6	P00427	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	HNM1	P19807	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YHL050C	P38721	697 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YHR219W	P38900	624 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	LAM5	P43560	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ZDS2	P54786	942 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
NUP133	YKR082W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MSB4	Q12317	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RPC82	P32349	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	GYP7	P48365	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	VPS15	P22219	1454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	REC107	P21651	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	UBX4	P54730	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	CDC25	P04821	1589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SNT2	P53127	1403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	INH1	P01097	85 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	COG6	P53959	839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
NUP133	YKR082W	APC2	Q12440	853 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	KIP2	P28743	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 52.7 ms