RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W DLD1P32891 587 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W ASH1P34233 588 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W CTR9P89105 1077 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RPN4Q03465 531 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W PSH1Q12161 406 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W TY1A-DR3Q12441 440 aa6.39□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W LEU1P07264 779 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W AFT1P22149 690 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W GRX1P25373 110 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W DAL1P32375 460 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W SLA1P32790 1244 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W ALG12P53730 551 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W FAR11P53917 953 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W ADI1Q03677 179 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W BDF2Q07442 638 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W SRF1Q12516 437 aa6.38□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RRP14P36080 434 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data6.37□□□□□ -1.39not detected
YKR047WYKR047W XDJ1P39102 459 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W PIC2P40035 300 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W NUT1P53114 1132 aa6.37□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W COBP00163 385 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W YIL165CP40446 119 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data6.36□□□□□ -1.39not detected
YKR047WYKR047W OPI10Q08202 246 aa6.36□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W GCR1P07261 785 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W DUT1P33317 147 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W FPR3P38911 411 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RVS167P39743 482 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W YJR115WP47152 169 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W SKP1P52286 194 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W HUL5P53119 910 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W ITC1P53125 1264 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W YGR053CP53234 283 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W MSH6Q03834 1242 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RTT10Q08924 1013 aa6.35□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RAS1P01119 309 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RAD4P14736 754 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RGP1P16664 663 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W DUR3P33413 735 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W SQT1P35184 431 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W TAT2P38967 592 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W BUD6P41697 788 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W VTC4P47075 721 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W RSM26P47141 266 aa6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
YKR047WYKR047W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W TIM54P47045 478 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W YJR098CP47139 656 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W PMT7Q06644 662 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W MRL1Q06815 381 aa6.33□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W APM2P38700 605 aa6.32□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W XKS1P42826 600 aa6.32□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W LSC2P53312 427 aa6.32□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W BAS1P22035 811 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W RAD27P26793 382 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W YKL069WP36088 180 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W SAP155P43612 1002 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W NUP85P46673 744 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W YNR040WP53736 256 aa6.31□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W UBP15P50101 1230 aa6.3□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W CCP1P00431 361 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W NCL1P38205 684 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W PEX28P38848 579 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W NUP82P40368 713 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W TYW3P53177 273 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W PEX13P80667 386 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W EEB1Q02891 456 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W POB3Q04636 552 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W TCB1Q12466 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W RIM11P38615 370 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W PPT1P53043 513 aa6.28□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YKR047WYKR047W MET6P05694 767 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W MRPL16P38064 232 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W GNP1P48813 663 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W YGL140CP53120 1219 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W RSC2Q06488 889 aa6.27□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W SEC23P15303 768 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W NPR1P22211 790 aa6.26□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W TIM23P32897 222 aa6.26□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W YER156CP40093 338 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W KRI1P42846 591 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W PPM2Q08282 695 aa6.26□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W FUS1P11710 512 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W MSH3P25336 1018 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W YBR184WP38299 523 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W SHU2P38957 223 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W MNN1P39106 762 aa6.25□□□□□ -1.41
YKR047WYKR047W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.4 ms