RNA–Protein interactions for RNA: YJR112W

NNF1, Transcript of Essential component of the MIND kinetochore complex, yeast

Gene NNF1, Length 606 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF1	YJR112W	PIN2	Q12057	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	AIM44	Q99299	758 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	UGA4	P32837	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	MAD1	P40957	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	NUT1	P53114	1132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	MON1	P53129	644 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	SCW11	P53189	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NNF1	YJR112W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	MRPS18	P42847	217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	ALD3	P54114	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	MCD1	Q12158	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	IDI1	P15496	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	CLN2	P20438	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	PET112	P33893	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	MNR2	P35724	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	VAC8	P39968	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	NNF1	P47149	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	PPT1	P53043	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	ULP1	Q02724	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	MSC7	P38694	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	SAP155	P43612	1002 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	HEH2	Q03281	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	ADI1	Q03677	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	RSC2	Q06488	889 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	YTA7	P40340	1379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	DIT1	P21623	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	RIM11	P38615	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	PIC2	P40035	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	ROG3	P43602	733 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	PMT7	Q06644	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	FUS1	P11710	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	CUZ1	P53899	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	GLO4	Q12320	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	CCP1	P00431	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	NPR1	P22211	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	YJL181W	P46987	611 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	YAF9	P53930	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	FPS1	P23900	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	DUT1	P33317	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	PRK1	P40494	810 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	CWC24	P53769	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	CAF120	P53836	1060 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NNF1	YJR112W	INO80	P53115	1489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	MRP10	O75012	95 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	CDC34	P14682	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	TFA2	P36145	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	RSM26	P47141	266 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	GCR1	P07261	785 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	SQT1	P35184	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	PEX28	P38848	579 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YIR007W	P40566	764 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	XKS1	P42826	600 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YJR124C	P47159	448 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
NNF1	YJR112W	CEM1	P39525	442 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	ACO2	P39533	789 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	LYS5	P50113	272 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	PEX13	P80667	386 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	SOG2	Q08817	791 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	MSH3	P25336	1018 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	LSB6	P42951	607 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	GNP1	P48813	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YGR053C	P53234	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NNF1	YJR112W	MRL1	Q06815	381 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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