RNA–Protein interactions for RNA: YJL078C

PRY3, Transcript of Cell wall-associated protein involved in export of acetylated sterols, yeast

Gene PRY3, Length 2,646 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRY3	YJL078C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	MYO3	P36006	1272 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	KIN4	Q01919	800 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	SKG3	Q06315	1026 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	ELG1	Q12050	791 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	GSC2	P40989	1895 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	FBP26	P32604	452 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	IRC4	Q03036	179 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	QCR6	P00127	147 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	YKU70	P32807	602 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	PEX14	P53112	341 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	TOS4	Q06266	489 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	MSP1	P28737	362 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	GLC3	P32775	704 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	GDE1	Q02979	1223 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	HXT10	P43581	546 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	TIM50	Q02776	476 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	PPM2	Q08282	695 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	HXT13	P39924	564 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	ATG20	Q07528	640 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	BIK1	P11709	440 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	GAL2	P13181	574 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PRY3	YJL078C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	HRQ1	Q05549	1077 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	EST2	Q06163	884 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	YPL260W	Q08977	551 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	MSM1	P22438	575 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	GRX7	P38068	203 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	SOL4	P53315	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	KIN1	P13185	1064 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	MAL31	P38156	614 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	INM2	Q05533	292 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	RSM25	P40496	264 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	ROG3	P43602	733 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	YLR278C	Q05854	1341 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PER1	P25625	357 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	RER2	P35196	286 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	HXT17	P53631	564 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	RTC4	P53850	401 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	CTI6	Q08923	506 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	AI2	P03876	854 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	ATG32	P40458	529 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	COQ1	P18900	473 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	ANP1	P32629	500 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	DIT2	P21595	489 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PUS6	P53294	404 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	GUD1	Q07729	489 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	TIP41	Q12199	356 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	CKA2	P19454	339 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	CWH41	P53008	833 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	YAF9	P53930	226 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	UFD2	P54860	961 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PEX19	Q07418	342 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	SPC110	P32380	944 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	CST26	P38226	397 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	YPT11	P48559	417 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	ALG1	P16661	449 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.28	□□□□□ -1.24	not detected
PRY3	YJL078C	MAK31	P23059	88 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	PRE8	P23639	250 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	TPM2	P40414	161 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	EAF6	P47128	113 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	YGL138C	P53122	345 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	ENV11	P53246	860 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	ERG12	P07277	443 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	SRM1	P21827	482 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	YHL050C	P38721	697 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	RET3	P53600	189 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PRY3	YJL078C	THI6	P41835	540 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PRY3	YJL078C	RXT2	P38255	430 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PRY3	YJL078C	CIR1	P42940	261 aa		7.27	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms