RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	VAN1	P23642	535 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
IKS1	YJL057C	BRF1	P29056	596 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	SFP1	P32432	683 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TAF1	P46677	1066 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	APL6	P46682	809 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	SRB7	P47822	140 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	UBA2	P52488	636 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	HOL1	P53389	586 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	NST1	P53935	1240 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YBR071W	P38243	211 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	SOH1	P38633	127 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	HLJ1	P48353	224 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	MET14	Q02196	202 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	NUP145	P49687	1317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	ESL1	P40456	1118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	PEX14	P53112	341 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YML131W	Q03102	365 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	CSC1	Q06538	782 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TRS33	Q99394	268 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	PLC1	P32383	869 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	ANP1	P32629	500 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	KTR2	P33550	425 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YHL008C	P38750	627 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	PMT3	P47190	753 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	RTA1	P53047	317 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YNL058C	P53947	316 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	FRA1	Q07825	749 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	MSB4	Q12317	492 aa		5.18	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	EUG1	P32474	517 aa		5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YBR184W	P38299	523 aa		5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.17	□□□□□ -1.58	not detected
IKS1	YJL057C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YGR016W	P53209	190 aa		5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TUB4	P53378	473 aa		5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	REH1	Q06709	432 aa		5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	THI73	Q07904	523 aa		5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	APC11	Q12157	165 aa		5.17	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	GAL1	P04385	528 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	MNT3	P40549	630 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	BFA1	P47113	574 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	STR2	P47164	639 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	UFD2	P54860	961 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	UME1	Q03010	460 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YLR352W	Q06479	807 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YPR084W	Q06821	456 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	HSP42	Q12329	375 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	QCR6	P00127	147 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	RRN3	P36070	627 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	BDS1	Q08347	646 aa		5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TFC4	P33339	1025 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	SLI15	P38283	698 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	TGL3	P40308	642 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	MAL11	P53048	616 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	YNL115C	P53925	644 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	CDC55	Q00362	526 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	VTI1	Q04338	217 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	PIB1	Q06651	286 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	OXR1	Q08952	273 aa		5.15	□□□□□ -1.58
IKS1	YJL057C	SPS1	P08458	490 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MCM10	P32354	571 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	RXT2	P38255	430 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	VTC2	P43585	828 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YDR056C	Q12025	205 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MSM1	P22438	575 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	YBR197C	P38306	217 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	ATG3	P40344	310 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	CDC45	Q08032	650 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	SSP2	Q08646	371 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	MED1	Q12321	566 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	OSH2	Q12451	1283 aa		5.14	□□□□□ -1.59
IKS1	YJL057C	BAS1	P22035	811 aa		5.13	□□□□□ -1.59

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