RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	VPS35	P34110	944 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	SAM37	P50110	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	LYS5	P50113	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	HEH2	Q03281	663 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	DUR3	P33413	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	CEM1	P39525	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	FLP1	P03870	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	SEC8	P32855	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	MNN4	P36044	1178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	PRK1	P40494	810 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	PPT1	P53043	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	ENV11	P53246	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	MRP10	O75012	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	MGE1	P38523	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	FYV10	P40492	516 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	YHL008C	P38750	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	DNA2	P38859	1522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	MCM2	P29469	868 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	TCB2	P48231	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	ALD3	P54114	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	MET1	P36150	593 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	AIM44	Q99299	758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	FUS1	P11710	512 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	RSC2	Q06488	889 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	TFA2	P36145	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	FAA3	P39002	694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	YJL181W	P46987	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	JJJ3	P47138	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	NUT1	P53114	1132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	SPR28	Q04921	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	HPF1	Q05164	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RIM4	YHL024W	RIM11	P38615	370 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	SAP155	P43612	1002 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	YGR122W	P53272	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	DAL4	Q04895	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	OXR1	Q08952	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	GLO4	Q12320	285 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
RIM4	YHL024W	UGA4	P32837	571 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	MON1	P53129	644 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	SPT7	P35177	1332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	CYC8	P14922	966 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	SOG2	Q08817	791 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	DPH6	Q12429	685 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	NPR1	P22211	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	YJR124C	P47159	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	YGR035C	P53222	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	YAF9	P53930	226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	ULP1	Q02724	621 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	PMT7	Q06644	662 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	RAD2	P07276	1031 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	LSB6	P42951	607 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	GIS4	Q04233	774 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	RMD1	Q03441	430 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	SVF1	Q05515	481 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RIM4	YHL024W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	PIC2	P40035	300 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	GUP1	P53154	560 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	ADI1	Q03677	179 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	KOG1	P38873	1557 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	TOP1	P04786	769 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	FET4	P40988	552 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	MRPS18	P42847	217 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RIM4	YHL024W	YPL062W	Q02781	134 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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