RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W AIM9P40053 627 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RNQ1YCL028W SPO22P40511 975 aa13.04□□□□□ -0.32
RNQ1YCL028W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RNQ1YCL028W NSG2P53898 299 aa13.03□□□□□ -0.32
RNQ1YCL028W SRS2P12954 1174 aa13.02□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W GLC3P32775 704 aa13.02□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W STV1P37296 890 aa13.02□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W VPS4P52917 437 aa13.02□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W PEP3P27801 918 aa13.01□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W RTS1P38903 757 aa13.01□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W YPL260WQ08977 551 aa13.01□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W AIM7Q12156 149 aa13.01□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W CHO2P05374 869 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data13□□□□□ -0.33not detected
RNQ1YCL028W FET4P40988 552 aa13□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W UFD2P54860 961 aa13□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W TIM50Q02776 476 aa13□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W TFC8Q12308 588 aa13□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W ARP5P53946 755 aa12.99□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W THS1P04801 734 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W HOP09932 586 aa12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W HPR1P17629 752 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W RER2P35196 286 aa12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W VID28P40547 921 aa12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W YJL171CP46992 396 aa12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W MTC3P53077 123 aa12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W FLO1P32768 1537 aa12.98□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W SIS2P36024 562 aa12.97□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W YGR117CP53270 476 aa12.97□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W RTG2P32608 588 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W YHL050CP38721 697 aa12.96□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W UTP7P40055 554 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W PCL8Q08966 492 aa12.96□□□□□ -0.33
RNQ1YCL028W VID27P40157 782 aa12.95□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W VPS20Q04272 221 aa12.95□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W RAD61Q99359 647 aa12.95□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W YLR278CQ05854 1341 aa12.94□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W CBP1P07252 654 aa12.94□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W EST2Q06163 884 aa12.94□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W ANP1P32629 500 aa12.93□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W NPA3P47122 385 aa12.93□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W YKE2P52553 114 aa12.93□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W ADP1P25371 1049 aa12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W IME2P32581 645 aa12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W FBP26P32604 452 aa12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W EMP47P43555 445 aa12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W HDA1P53973 706 aa12.92□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W MYO3P36006 1272 aa12.91□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W VPS24P36095 224 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W CTF18P49956 741 aa12.91□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W ECM23Q02710 187 aa12.91□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W PMA1P05030 918 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W RIT1P23796 513 aa12.9□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W YBL028CP38202 106 aa12.9□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W VPS8P39702 1274 aa12.9□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W PTK2P47116 818 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RNQ1YCL028W MATALPHA2P0CY08 210 aa12.89□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W HMLALPHA2P0CY09 210 aa12.89□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W NIT1P40447 199 aa12.89□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W ENT3P47160 408 aa12.89□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W TFC6Q06339 672 aa12.89□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W PSK2Q08217 1101 aa12.89□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W BIK1P11709 440 aa12.88□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W PRE8P23639 250 aa12.88□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W PRO3P32263 286 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W PUS5Q06244 254 aa12.88□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W MPH3P0CE00 602 aa12.87□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data12.87□□□□□ -0.35not detected
RNQ1YCL028W SRM1P21827 482 aa12.87□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W RAD53P22216 821 aa12.87□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W YHL017WP38745 532 aa12.87□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W EPL1P43572 832 aa12.87□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W YGL081WP53156 320 aa12.87□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W KIN1P13185 1064 aa12.86□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W MAK31P23059 88 aa12.86□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W TTI1P36097 1038 aa12.86□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W AKR1P39010 764 aa12.86□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W ALG2P43636 503 aa12.86□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W EAF7P53911 425 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W CST26P38226 397 aa12.85□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W CSM2P40465 213 aa12.85□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W DJP1P40564 432 aa12.85□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W BUD6P41697 788 aa12.85□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W SNU71P53207 620 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W ACE2P21192 770 aa12.84□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W ELG1Q12050 791 aa12.84□□□□□ -0.35
RNQ1YCL028W GAL2P13181 574 aa12.83□□□□□ -0.36
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