RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPOAP1O95153 1857 aa25.63■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.63■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP19O94966 1318 aa25.63■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 MLECQ14165 292 aa25.62■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.62■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.61■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.61■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIPK4P57078 832 aa25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP35Q9P2H5 1018 aa25.59■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.59■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.58■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
AFG3L1P-217ENST00000557444 MED14O60244 1454 aa25.56■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 NFKBIBQ15653 356 aa25.56■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM27P14373 513 aa25.56■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.54■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.54■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 AAMPQ13685 434 aa25.54■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.53■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLKQ9UBT6 870 aa25.52■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 DIP2BQ9P265 1576 aa25.52■■□□□ 1.68
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.51■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.51■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRKAR2BP31323 418 aa25.5■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 HMOX1P09601 288 aa25.49■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.49■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.48■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.48■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.48■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.47■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL16Q14005 1332 aa25.47■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.47■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.47■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.46■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 FCHSD2O94868 740 aa25.45■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 NME9Q86XW9 330 aa25.45■■□□□ 1.67
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.45■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.44■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 METP08581 1390 aa25.44■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 DLC1Q96QB1 1528 aa25.43■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 AGLP35573 1532 aa25.43■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.42■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP7BP35670 1465 aa25.42■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.42■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.41■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.4■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 REREQ9P2R6 1566 aa25.4■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.39■■□□□ 1.66
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.39■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.37■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.36■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 NFE2L2Q16236 605 aa25.36■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF16BQ96L93 1317 aa25.36■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL13P35225 146 aa25.35■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 TSPYL6Q8N831 410 aa25.35■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 GSE1Q14687 1217 aa25.34■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZMYM3Q14202 1370 aa25.34■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 CPS1P31327 1500 aa25.33■■□□□ 1.65
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.33■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 BECN1Q14457 450 aa25.32■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMC5Q8IY18 1101 aa25.31■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 VAMP4O75379 141 aa25.3■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 COG3Q96JB2 828 aa25.29■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.29■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM83GA6ND36 823 aa25.29■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 MBIPQ9NS73 344 aa25.29■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL27Q8NEV9 243 aa25.28■■□□□ 1.64
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