RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 LTKP29376 864 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 MORC1Q86VD1 984 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 CDK19Q9BWU1 502 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 NUDCQ9Y266 331 aa10.28□□□□□ -0.76
CS-204ENST00000546621 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CS-204ENST00000546621 CD163L1Q9NR16 1453 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-204ENST00000546621 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.27□□□□□ -0.77
CS-204ENST00000546621 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
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CS-204ENST00000546621 MED14O60244 1454 aa10.26□□□□□ -0.77
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CS-204ENST00000546621 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
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CS-204ENST00000546621 ADAMTSL3P82987 1691 aa10.25□□□□□ -0.77
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CS-204ENST00000546621 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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CS-204ENST00000546621 PTPRUQ92729 1446 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-204ENST00000546621 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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CS-204ENST00000546621 SHPRHQ149N8 1683 aa10.21□□□□□ -0.77
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CS-204ENST00000546621 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 FYB1O15117 783 aa10.2□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.2□□□□□ -0.78
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CS-204ENST00000546621 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 RNF123Q5XPI4 1314 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 MTHFSP49914 203 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 CFAP53Q96M91 514 aa10.19□□□□□ -0.78
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CS-204ENST00000546621 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.19□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
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CS-204ENST00000546621 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
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CS-204ENST00000546621 ITSN1Q15811 1721 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.18□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 PIK3R4Q99570 1358 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 ZNF521Q96K83 1311 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 NGEFQ8N5V2 710 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.17□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 FGD1P98174 961 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 PDE4CQ08493 712 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 USP35Q9P2H5 1018 aa10.16□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 APAF1O14727 1248 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 ILDR2Q71H61 639 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.15□□□□□ -0.78
CS-204ENST00000546621 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.14□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 GOLGA2Q08379 1002 aa10.14□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 RUNDC1Q96C34 613 aa10.14□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.14□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 ARXQ96QS3 562 aa10.13□□□□□ -0.79
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CS-204ENST00000546621 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
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CS-204ENST00000546621 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 KCNA6P17658 529 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 RRP1P56182 461 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 SLFN5Q08AF3 891 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 NME9Q86XW9 330 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 AATKQ6ZMQ8 1374 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
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