RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 MED14O60244 1454 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.26□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 BCL2L13Q9BXK5 485 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 GBP4Q96PP9 640 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.25□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 PIK3C2BO00750 1634 aa13.24□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 CD109Q6YHK3 1445 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 RRP9O43818 475 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 TRIM27P14373 513 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 PANK2Q9BZ23 570 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 EVC2Q86UK5 1308 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 NUCB1Q02818 461 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 ZNF428Q96B54 188 aa13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 ALDH1L2Q3SY69 923 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 ESPNB1AK53 854 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 BMP2KLQ5H9B9 411 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 PLEKHF1Q96S99 279 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-202ENST00000542324 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TMPOP42166 694 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.21□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 SSH1Q8WYL5 1049 aa13.21□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 NPATQ14207 1427 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 CFAP44Q96MT7 982 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TRIM35Q9UPQ4 493 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 PIK3R4Q99570 1358 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 ZFYVE9O95405 1425 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TPM2P07951 284 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 CHD1LQ86WJ1 897 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TMEM57Q8N5G2 664 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 GCC1Q96CN9 775 aa13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 PTCH1Q13635 1447 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 CCDC173Q0VFZ6 552 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 ABCC3O15438 1527 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 ATAD2Q6PL18 1390 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 ARXQ96QS3 562 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 PNPLA6Q8IY17 1366 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-202ENST00000542324 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PP64 1363 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 KIF2CQ99661 725 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 ASXL2Q76L83 1435 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 TERF1P54274 439 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 ERBB4Q15303 1308 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 KLHL40Q2TBA0 621 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 GAS2L3Q86XJ1 694 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 LNPKQ9C0E8 428 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 RIPK4P57078 832 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 HS1BP3Q53T59 392 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CS-202ENST00000542324 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.1□□□□□ -0.31
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