RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 PNPLA6Q8IY17 1366 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 A2ML1A8K2U0 1454 aa19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 DIP2BQ9P265 1576 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 USP19O94966 1318 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 USP35Q9P2H5 1018 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 AGLP35573 1532 aa19.97■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 FBLN1P23142 703 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 MVPQ14764 893 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 RIPK4P57078 832 aa19.96■□□□□ 0.79
ANKRD54-210ENST00000498417 SEC24BO95487 1268 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 REREQ9P2R6 1566 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 RIMS2Q9UQ26 1411 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 TSPOAP1O95153 1857 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 IL16Q14005 1332 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 MLECQ14165 292 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 DLC1Q96QB1 1528 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 POLKQ9UBT6 870 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 TRIM27P14373 513 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 FCHSD2O94868 740 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
ANKRD54-210ENST00000498417 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP7BP35670 1465 aa19.89■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.88■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 PRKAR2BP31323 418 aa19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 NFKBIBQ15653 356 aa19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 METP08581 1390 aa19.87■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.86■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 ZMYM3Q14202 1370 aa19.85■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 NME9Q86XW9 330 aa19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.84■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 HMOX1P09601 288 aa19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM57Q8N5G2 664 aa19.83■□□□□ 0.77
ANKRD54-210ENST00000498417 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.83■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 IL13P35225 146 aa19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 NFE2L2Q16236 605 aa19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa19.8■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF16BQ96L93 1317 aa19.79■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 SIRT1Q96EB6 747 aa19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 TBC1D32Q96NH3 1257 aa19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 CPS1P31327 1500 aa19.77■□□□□ 0.76
ANKRD54-210ENST00000498417 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 SMC5Q8IY18 1101 aa19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 VAMP4O75379 141 aa19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 TSPYL6Q8N831 410 aa19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 TECPR2O15040 1411 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 COG3Q96JB2 828 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF853P0CG23 659 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF428Q96B54 188 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 PRR36Q9H6K5 1346 aa19.74■□□□□ 0.75
ANKRD54-210ENST00000498417 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms