RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473661.5

TTLL3-225, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 5

Gene TTLL3, Length 3,811 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-225	ENST00000473661	ORAI2	Q96SN7	254 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	SOX12	O15370	315 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	NLRP6	P59044	892 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	USP6	P35125	1406 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-225	ENST00000473661	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	DCC	P43146	1447 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	ITSN1	Q15811	1721 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	USP32	Q8NFA0	1604 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	FBLN1	P23142	703 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	NEFM	P07197	916 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	AMPH	P49418	695 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	MST1R	Q04912	1400 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-225	ENST00000473661	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	TOM1	O60784	492 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TTLL3-225	ENST00000473661	APAF1	O14727	1248 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	GC	P02774	474 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	INSR	P06213	1382 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	FLT4	P35916	1363 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	HMOX1	P09601	288 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	FCHSD2	O94868	740 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	IL13	P35225	146 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	HOXC9	P31274	260 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.2
TTLL3-225	ENST00000473661	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-225	ENST00000473661	IP6K1	Q92551	441 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-225	ENST00000473661	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-225	ENST00000473661	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TTLL3-225	ENST00000473661	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TTLL3-225	ENST00000473661	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.76	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms